More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0039 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1220  Tn554, rRNA adenine N-6-methyltransferase  100 
 
 
243 aa  496  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00652696  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0039  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  100 
 
 
243 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2510  rRNA adenine N-6-methyltransferase  100 
 
 
243 aa  496  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1747  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  100 
 
 
243 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0257214  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1343  Tn554, rRNA adenine N-6-methyltransferase  100 
 
 
243 aa  496  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1713  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  100 
 
 
243 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0039  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  100 
 
 
243 aa  496  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1672  dimethyladenosine transferase  33.33 
 
 
263 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0456  dimethyladenosine transferase  28.86 
 
 
261 aa  98.6  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.45275  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0806  dimethyladenosine transferase  32.81 
 
 
263 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68016  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0228  dimethyladenosine transferase  31.5 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1492  dimethyladenosine transferase  32.77 
 
 
279 aa  95.5  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6125  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  29.63 
 
 
263 aa  95.1  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426538  hitchhiker  0.00598372 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0213  dimethyladenosine transferase  29.01 
 
 
297 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0313  dimethyladenosine transferase  31.22 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2840  dimethyladenosine transferase  30.41 
 
 
285 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2526  dimethyladenosine transferase  30.41 
 
 
285 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3810  dimethyladenosine transferase  30.84 
 
 
277 aa  92.4  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2313  dimethyladenosine transferase  30.5 
 
 
271 aa  92.4  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2586  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  28.63 
 
 
331 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.970402  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0858  dimethyladenosine transferase  28.17 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4886  dimethyladenosine transferase  25.97 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00215913  hitchhiker  0.00477797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1867  dimethyladenosine transferase  32.11 
 
 
288 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1613  dimethyladenosine transferase  27.63 
 
 
295 aa  90.1  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0069  dimethyladenosine transferase  30.48 
 
 
273 aa  89  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  6.61842e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0052  dimethyladenosine transferase  25.77 
 
 
288 aa  88.6  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  8.22785e-05 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0376  dimethyladenosine transferase  30.3 
 
 
271 aa  88.6  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2047  dimethyladenosine transferase  30.96 
 
 
276 aa  88.6  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0237  dimethyladenosine transferase  34.31 
 
 
258 aa  87.8  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1772  dimethyladenosine transferase  30.83 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0718  dimethyladenosine transferase  29.67 
 
 
294 aa  86.7  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2264  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  27.6 
 
 
266 aa  85.9  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.627162 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3423  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  27.08 
 
 
253 aa  85.9  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0131  dimethyladenosine transferase  26.62 
 
 
296 aa  85.9  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.273731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0389  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  23.83 
 
 
256 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317116  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1549  dimethyladenosine transferase  33.52 
 
 
292 aa  84.7  1e-15  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0053  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  31.69 
 
 
294 aa  85.1  1e-15  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  5.7406e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0404  dimethyladenosine transferase  32.18 
 
 
291 aa  84.3  2e-15  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0902  dimethyladenosine transferase  29.82 
 
 
270 aa  84.3  2e-15  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000593954  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2492  dimethyladenosine transferase  28.98 
 
 
271 aa  84  2e-15  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000182898  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1509  dimethyladenosine transferase  26.51 
 
 
280 aa  83.6  2e-15  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  4.52453e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2309  dimethyladenosine transferase  28.5 
 
 
275 aa  83.2  3e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  2.65248e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1779  dimethyladenosine transferase  30.41 
 
 
290 aa  83.2  4e-15  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4477  dimethyladenosine transferase  28.34 
 
 
273 aa  82.8  4e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0996  dimethyladenosine transferase  29.02 
 
 
249 aa  83.2  4e-15  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.143714  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17860  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  27.65 
 
 
244 aa  82.8  5e-15  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0528  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  23.71 
 
 
253 aa  82.8  5e-15  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3234  dimethyladenosine transferase  30.89 
 
 
287 aa  82.4  6e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690544  normal  0.0840348 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_347  dimethyladenosine transferase  31.21 
 
 
291 aa  82.4  6e-15  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0036  dimethyladenosine transferase  29.02 
 
 
292 aa  82.4  6e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3899  dimethyladenosine transferase  26.88 
 
 
290 aa  82  7e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.47606e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0037  dimethyladenosine transferase  29.02 
 
 
292 aa  82  9e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00019411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0040  dimethyladenosine transferase  29.02 
 
 
292 aa  82  9e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0546968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0037  dimethyladenosine transferase  29.02 
 
 
292 aa  82  9e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0039  dimethyladenosine transferase  29.02 
 
 
292 aa  82  9e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0039  dimethyladenosine transferase  29.02 
 
 
292 aa  82  9e-15  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0046  dimethyladenosine transferase  29.02 
 
 
292 aa  82  9e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0050  dimethyladenosine transferase  29.02 
 
 
292 aa  82  9e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  30.84 
 
 
301 aa  81.6  1e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  25.11 
 
 
267 aa  81.3  1e-14  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  28.72 
 
 
268 aa  81.3  1e-14  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5270  dimethyladenosine transferase  27.98 
 
 
292 aa  80.9  2e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4526  dimethyladenosine transferase  23.35 
 
 
301 aa  80.5  2e-14  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0046  dimethyladenosine transferase  27.98 
 
 
292 aa  80.9  2e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  23.23 
 
 
274 aa  80.5  2e-14  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  25.4 
 
 
297 aa  80.1  3e-14  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  25.4 
 
 
297 aa  80.1  3e-14  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28640  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  27.96 
 
 
269 aa  79.7  3e-14  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  25.61 
 
 
299 aa  79.7  4e-14  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1864  dimethyladenosine transferase  27 
 
 
276 aa  79.7  4e-14  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131942  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0037  dimethyladenosine transferase  27.46 
 
 
291 aa  79.3  5e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0035  dimethyladenosine transferase  25.35 
 
 
293 aa  79.3  5e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  29.78 
 
 
256 aa  78.6  8e-14  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0383  dimethyladenosine transferase  29.89 
 
 
291 aa  78.6  8e-14  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1177  dimethyladenosine transferase  27.64 
 
 
262 aa  78.6  8e-14  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.0114034 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1080  dimethyladenosine transferase  27.27 
 
 
293 aa  78.6  8e-14  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0706  dimethyladenosine transferase  32.79 
 
 
281 aa  77.8  1e-13  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.486021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0171  dimethyladenosine transferase  28.69 
 
 
290 aa  78.6  1e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  27.68 
 
 
459 aa  77.8  1e-13  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  30.46 
 
 
256 aa  77.8  1e-13  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  24.89 
 
 
268 aa  77  2e-13  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0880  dimethyladenosine transferase  31.12 
 
 
261 aa  77.4  2e-13  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  3.57619e-09  decreased coverage  0.00867661 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0036  dimethyladenosine transferase  26.67 
 
 
292 aa  77  2e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3490  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  25.64 
 
 
278 aa  77  2e-13  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  29.1 
 
 
270 aa  77  2e-13  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0527  dimethyladenosine transferase  26.24 
 
 
297 aa  77.4  2e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0439475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2092  dimethyladenosine transferase  30.57 
 
 
284 aa  77  2e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000751415  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0514  dimethyladenosine transferase  26.24 
 
 
297 aa  77.4  2e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00510308  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0513  dimethyladenosine transferase  31.82 
 
 
273 aa  77.8  2e-13  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1612  dimethyladenosine transferase  30.65 
 
 
275 aa  77.4  2e-13  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  26.57 
 
 
276 aa  77  3e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0346  dimethyladenosine transferase  26.92 
 
 
268 aa  76.6  3e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335401  normal  0.775767 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0167  dimethyladenosine transferase  26.92 
 
 
267 aa  77  3e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.314995  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0208  dimethyladenosine transferase  28.99 
 
 
298 aa  76.6  3e-13  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  3.98679e-05  normal  0.017695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0708  dimethyladenosine transferase  27.81 
 
 
281 aa  76.3  4e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1171  dimethyladenosine transferase  28.16 
 
 
276 aa  76.6  4e-13  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00874938  normal  0.712777 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  30.73 
 
 
260 aa  76.3  5e-13  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  7.35455e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3509  dimethyladenosine transferase  25.96 
 
 
314 aa  75.9  6e-13  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.627575  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0251  dimethyladenosine transferase  26.04 
 
 
297 aa  75.9  6e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0907  dimethyladenosine transferase  24.38 
 
 
296 aa  75.9  6e-13  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  5.52021e-11  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>