More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0032 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0032  ROK family protein  100 
 
 
369 aa  734  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0032  ROK family protein  100 
 
 
369 aa  734  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2517  xylose repressor  100 
 
 
369 aa  734  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0778227  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  34.58 
 
 
381 aa  180  3e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.11395e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0129  transcriptional regulator/sugar kinase, xylose operon regulator  33.07 
 
 
389 aa  178  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  30.14 
 
 
364 aa  130  4e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.03 
 
 
408 aa  128  2e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  8.7715e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  26.72 
 
 
395 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  26.68 
 
 
363 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  26.84 
 
 
409 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  27.11 
 
 
414 aa  117  4e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  34.65 
 
 
397 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  32.48 
 
 
391 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  23.56 
 
 
400 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  25.33 
 
 
399 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  26.82 
 
 
381 aa  106  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  30.68 
 
 
399 aa  106  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  23.43 
 
 
434 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  25.16 
 
 
384 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  24.44 
 
 
389 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  25.79 
 
 
381 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  22.59 
 
 
405 aa  103  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25.78 
 
 
410 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  22.73 
 
 
410 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  29.24 
 
 
405 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  26.23 
 
 
416 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  21.47 
 
 
397 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  23.24 
 
 
393 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  23.18 
 
 
405 aa  99.8  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  27.84 
 
 
292 aa  99.4  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  27.49 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  24.29 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  22.99 
 
 
408 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  22.82 
 
 
396 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  27.89 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  27.49 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  27.49 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  28.14 
 
 
292 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.12 
 
 
383 aa  96.7  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  22.93 
 
 
408 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  27.35 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  26.65 
 
 
378 aa  95.5  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  26.46 
 
 
292 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  22.71 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  23.1 
 
 
418 aa  93.2  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  24.67 
 
 
406 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  24.67 
 
 
406 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  24.67 
 
 
406 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  24.67 
 
 
406 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  24.67 
 
 
406 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  27.15 
 
 
292 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  23.68 
 
 
404 aa  92.8  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  24.34 
 
 
406 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  24.54 
 
 
405 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  22.79 
 
 
389 aa  92  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  9.05056e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  22.48 
 
 
399 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  23.18 
 
 
407 aa  90.9  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  24.27 
 
 
410 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  26.12 
 
 
292 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  24.48 
 
 
402 aa  90.5  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  1.18651e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  21.96 
 
 
401 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  24.46 
 
 
395 aa  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  25.96 
 
 
378 aa  89.4  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  24.27 
 
 
381 aa  89.4  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  2.35996e-05 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  24.32 
 
 
408 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  24.33 
 
 
390 aa  89  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  21.49 
 
 
404 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  22.43 
 
 
404 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  24.56 
 
 
396 aa  88.6  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  24.32 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  24.32 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  24.29 
 
 
395 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  25.62 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  25.62 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  25.62 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.39309e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  25.62 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  27.51 
 
 
393 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  25.62 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  22.26 
 
 
396 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  25.62 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  25.62 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  23.68 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  22.29 
 
 
397 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  20.5 
 
 
386 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  25.62 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  25.62 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  23.8 
 
 
406 aa  87  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  23.26 
 
 
405 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  26.5 
 
 
385 aa  87  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  23.53 
 
 
405 aa  87  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  23.85 
 
 
420 aa  87  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  22.6 
 
 
404 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  22.68 
 
 
417 aa  86.7  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  19.83 
 
 
396 aa  86.7  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  27.6 
 
 
292 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  25.59 
 
 
379 aa  86.7  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  23.68 
 
 
407 aa  86.3  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  28.27 
 
 
400 aa  86.3  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  23.01 
 
 
404 aa  85.9  1e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  22.04 
 
 
414 aa  85.5  1e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>