298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0004 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  100 
 
 
370 aa  759  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  87.87 
 
 
371 aa  682  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  100 
 
 
370 aa  759  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  56.99 
 
 
374 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.14234e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  56.72 
 
 
372 aa  440  1e-122  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  55.65 
 
 
375 aa  418  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.04808e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  55.65 
 
 
375 aa  418  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  55.65 
 
 
375 aa  418  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  55.65 
 
 
375 aa  418  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  55.65 
 
 
375 aa  418  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  56.18 
 
 
373 aa  417  1e-115  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  55.65 
 
 
375 aa  417  1e-115  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  55.65 
 
 
375 aa  417  1e-115  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  55.65 
 
 
375 aa  416  1e-115  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  55.65 
 
 
375 aa  417  1e-115  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  55.11 
 
 
375 aa  416  1e-115  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  52.42 
 
 
374 aa  404  1e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  51.08 
 
 
374 aa  382  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  46.54 
 
 
373 aa  346  4e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  45.8 
 
 
374 aa  339  4e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  45.38 
 
 
366 aa  318  8e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  44.84 
 
 
369 aa  314  2e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  47.03 
 
 
359 aa  311  1e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  43.57 
 
 
386 aa  291  9e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  41.24 
 
 
375 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  40.54 
 
 
361 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  40.54 
 
 
361 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  42.06 
 
 
371 aa  286  3e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  40.22 
 
 
371 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  40.16 
 
 
360 aa  265  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  38.55 
 
 
369 aa  253  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  35.75 
 
 
364 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.5 
 
 
365 aa  245  1e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.17 
 
 
372 aa  244  2e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.47 
 
 
376 aa  239  7e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  36.63 
 
 
371 aa  235  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  34.69 
 
 
392 aa  229  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.41 
 
 
364 aa  226  5e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  34.68 
 
 
364 aa  226  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  36.03 
 
 
384 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1123  recombination protein F  38.06 
 
 
380 aa  219  4e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1094  recombination protein F  38.06 
 
 
380 aa  219  4e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  34.88 
 
 
370 aa  219  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.69508e-07  hitchhiker  1.45417e-07 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  38.07 
 
 
376 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  32.83 
 
 
398 aa  216  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.01 
 
 
382 aa  212  8e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  34.23 
 
 
362 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0002  recombination protein F  31.9 
 
 
365 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.83 
 
 
377 aa  206  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  34.48 
 
 
377 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  31.99 
 
 
371 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  32.91 
 
 
394 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  30.59 
 
 
365 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  37.27 
 
 
386 aa  202  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  35.49 
 
 
390 aa  201  1e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  36.93 
 
 
387 aa  201  1e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.98 
 
 
360 aa  201  2e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.44 
 
 
363 aa  198  2e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  33.33 
 
 
370 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  33.15 
 
 
369 aa  196  5e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.87 
 
 
359 aa  196  8e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  31.92 
 
 
387 aa  195  9e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0003  recombination protein F  31.44 
 
 
368 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00792918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  37.03 
 
 
377 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.08 
 
 
369 aa  190  3e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20191  recombination protein F  32.94 
 
 
348 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.88 
 
 
370 aa  188  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1145  recombination protein F  32.94 
 
 
348 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  32.74 
 
 
385 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.56 
 
 
372 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16931  recombination protein F  34.09 
 
 
352 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.919518  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.75 
 
 
397 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.68 
 
 
362 aa  186  7e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.15018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  31.13 
 
 
390 aa  184  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  29.82 
 
 
414 aa  183  4e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  30.18 
 
 
390 aa  182  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  3.32989e-05  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  30.52 
 
 
359 aa  182  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  32.18 
 
 
373 aa  182  9e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.16 
 
 
397 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.03 
 
 
372 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.69 
 
 
374 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.53 
 
 
363 aa  181  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  29.65 
 
 
371 aa  180  3e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0003  DNA repair and genetic recombination protein  32.54 
 
 
365 aa  180  3e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  28.42 
 
 
359 aa  180  3e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  28.97 
 
 
390 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  31.02 
 
 
367 aa  179  5e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  2.41058e-09 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  31.59 
 
 
401 aa  179  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.47 
 
 
398 aa  179  8e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  29.44 
 
 
404 aa  179  8e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  31.08 
 
 
399 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1434  recombinational DNA repair ATPase  34.23 
 
 
395 aa  178  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  32.35 
 
 
363 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.03 
 
 
399 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2450  DNA replication and repair protein RecF  32.08 
 
 
366 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  31.83 
 
 
376 aa  177  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  1.32668e-05 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.49 
 
 
401 aa  176  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0234523  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  31.82 
 
 
401 aa  175  1e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  32.36 
 
 
402 aa  175  1e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.15476e-13 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.09 
 
 
365 aa  174  2e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>