193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_R0056 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_R0014  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  147  4e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.81617e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  147  4e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0014  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  147  4e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  3.88984e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  98.65 
 
 
77 bp  139  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  8.84624e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  98.65 
 
 
74 bp  139  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0051  tRNA-Arg  97.3 
 
 
77 bp  131  2e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  1.938e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0104  tRNA-Arg  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  5.27432e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  5.00778e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  6.92763e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  97.3 
 
 
77 bp  131  2e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  7.2092e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0137  tRNA-Arg  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00346099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0218  tRNA-Arg  97.3 
 
 
79 bp  131  2e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.64905e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0024  tRNA-Arg  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0223361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4571  tRNA-Arg  97.3 
 
 
79 bp  131  2e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  6.05128e-11  normal  0.110688 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5044  tRNA-Arg  97.3 
 
 
77 bp  131  2e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.77575e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0277  tRNA-Arg  97.3 
 
 
77 bp  131  2e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0785  tRNA-Arg  97.3 
 
 
79 bp  131  2e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.40314e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4997  tRNA-Arg  97.3 
 
 
79 bp  131  2e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0100  tRNA-Arg  97.3 
 
 
77 bp  131  2e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00184606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0051  tRNA-Arg  97.3 
 
 
77 bp  131  2e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  7.84073e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0024  tRNA-Arg  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0232798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0133  tRNA-Arg  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  9.90226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5813  tRNA-Arg  97.3 
 
 
79 bp  131  2e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  97.3 
 
 
80 bp  131  2e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.43078e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  97.3 
 
 
80 bp  131  2e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.23953e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  97.3 
 
 
77 bp  131  2e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.23447e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  97.3 
 
 
77 bp  131  2e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000847547  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5664  tRNA-Arg  97.3 
 
 
77 bp  131  2e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  4.9458e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5694  tRNA-Arg  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.35784e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5726  tRNA-Arg  97.3 
 
 
74 bp  131  2e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  8.59141e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  97.3 
 
 
77 bp  131  2e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.19464e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5028  tRNA-Arg  97.3 
 
 
79 bp  131  2e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.52339e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0299  tRNA-Arg  97.3 
 
 
77 bp  131  2e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  7.67893e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  97.3 
 
 
77 bp  131  2e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0101  tRNA-Arg  97.3 
 
 
79 bp  131  2e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00157662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5732  tRNA-Arg  97.3 
 
 
79 bp  131  2e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.00542e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5672  tRNA-Arg  97.3 
 
 
77 bp  131  2e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.12746e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  97.3 
 
 
77 bp  131  2e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000407513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  97.3 
 
 
80 bp  131  2e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.2583e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  97.3 
 
 
77 bp  131  2e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.01078e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5639  tRNA-Arg  97.3 
 
 
79 bp  131  2e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  97.3 
 
 
77 bp  131  2e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0860  tRNA-Arg  97.3 
 
 
79 bp  131  2e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.6411e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0044  tRNA-Arg  93.24 
 
 
77 bp  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0022  tRNA-Arg  95 
 
 
77 bp  95.6  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  2.7529e-12  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0026  tRNA-Arg  94.83 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0014  tRNA-Arg  91.04 
 
 
74 bp  85.7  1e-15  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0054104  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0048  tRNA-Arg  91.04 
 
 
77 bp  85.7  1e-15  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00527947  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2212  tRNA-Arg  89.19 
 
 
77 bp  83.8  5e-15  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.249062  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2137  tRNA-Arg  89.19 
 
 
77 bp  83.8  5e-15  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0099  tRNA-Arg  91.8 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108565  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0053  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0223382  normal  0.521756 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0053  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  3.76557e-08  hitchhiker  8.69297e-22 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt025  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000274648  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0020  tRNA-Arg  87.84 
 
 
74 bp  75.8  1e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0062  tRNA-Arg  87.84 
 
 
77 bp  75.8  1e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0070  tRNA-Arg  87.84 
 
 
74 bp  75.8  1e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0080  tRNA-Arg  87.84 
 
 
74 bp  75.8  1e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1683  tRNA-Arg  87.84 
 
 
77 bp  75.8  1e-12  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.792102  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0050  tRNA-Arg  87.84 
 
 
77 bp  75.8  1e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000344943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0023  tRNA-Arg  87.84 
 
 
77 bp  75.8  1e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.157994  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0098  tRNA-Arg  87.84 
 
 
77 bp  75.8  1e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.37653e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0111  tRNA-Arg  87.84 
 
 
74 bp  75.8  1e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0063  tRNA-Arg  90 
 
 
77 bp  71.9  2e-11  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.257054  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0024  tRNA-Arg  93.75 
 
 
77 bp  71.9  2e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  4.41917e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0740  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0038  tRNA-Arg  93.48 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0257046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0065  tRNA-Arg  88.71 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.68192e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R27  tRNA-Arg  86.49 
 
 
77 bp  67.9  3e-10  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.469353  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1223  tRNA-Arg  89.66 
 
 
74 bp  67.9  3e-10  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0782259  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1468  tRNA-Arg  86.3 
 
 
74 bp  65.9  1e-09  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1761  tRNA-Arg  86.3 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  86.3 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.581803  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2040  tRNA-Arg  86.3 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  1.58642e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0008  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119735  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0003  tRNA-Arg  94.87 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0040  tRNA-Arg  88.14 
 
 
74 bp  61.9  2e-08  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  7.53452e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t32  tRNA-Arg  86.57 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0011176  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0006  tRNA-Arg  87.14 
 
 
73 bp  60  7e-08  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652554  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0038  tRNA-Arg  88.89 
 
 
77 bp  60  7e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.427754  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0009  tRNA-Arg  90 
 
 
77 bp  60  7e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.190028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0057  tRNA-Arg  86.49 
 
 
76 bp  60  7e-08  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0055  tRNA-Arg  86.49 
 
 
76 bp  60  7e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0065  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  60  7e-08  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0007  tRNA-Arg  86.49 
 
 
73 bp  60  7e-08  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.818817  hitchhiker  1.44488e-05 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0019  tRNA-Arg  87.72 
 
 
77 bp  58  3e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0224429  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0574  tRNA-Arg  87.72 
 
 
79 bp  58  3e-07  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0911  tRNA-Arg  87.72 
 
 
74 bp  58  3e-07  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0732179  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0006  tRNA-Arg  87.69 
 
 
73 bp  58  3e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0057  tRNA-Arg  86.3 
 
 
73 bp  58  3e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32045  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0054  tRNA-Arg  86.3 
 
 
73 bp  58  3e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0007  tRNA-Arg  86.3 
 
 
73 bp  58  3e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0172  tRNA-Arg  87.72 
 
 
74 bp  58  3e-07  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.678062  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0009  tRNA-Arg  86.3 
 
 
73 bp  58  3e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00118273  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0011  tRNA-Arg  92.68 
 
 
77 bp  58  3e-07  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0056  tRNA-Arg  86.3 
 
 
73 bp  58  3e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0040  tRNA-Arg  89.8 
 
 
77 bp  58  3e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0238659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0061  tRNA-Arg  86.3 
 
 
73 bp  58  3e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0007  tRNA-Arg  86.3 
 
 
76 bp  58  3e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>