184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_R0052 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP_tRNA-Met-3  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0052  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0052  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.52519  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5722  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00777466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0222  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000871168  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-1  tRNA-Met  91.89 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000949861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5024  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-8  tRNA-Met  91.89 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.657815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-4  tRNA-Met  91.89 
 
 		 80 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000411015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4993  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1573  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1608  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.838152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5809  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0133  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0084  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0035  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0129  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000915038  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-7  tRNA-Met  91.78 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000084992  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0744  tRNA-Met  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0074  tRNA-Met  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0141548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0011  tRNA-Met  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0011  tRNA-Met  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.259096  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0565  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0119  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0115  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.791558  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  93.22 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0033  tRNA-Met  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507086  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5791  tRNA-Met  89.19 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5708  tRNA-Met  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115547  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-8  tRNA-Met  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00195943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-7  tRNA-Met  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-1  tRNA-Met  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0139099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-5  tRNA-Met  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0844  tRNA-Met  89.19 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.639074  normal  0.0213952 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4296  tRNA-Met  89.19 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000610451 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4409  tRNA-Met  89.19 
 
 		 79 bp  83.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00224529  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0054  tRNA-Met  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0031  tRNA-Met  90.48 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0175  tRNA-Met  90.48 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.183905  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0029  tRNA-Met  91.53 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00945673 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-3  tRNA-Met  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-2  tRNA-Met  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.582141  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0002  tRNA-Met  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00524383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0033  tRNA-Met  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0004  tRNA-Met  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0045  tRNA-Met  91.38 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000299678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0070  tRNA-Met  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0320721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0017  tRNA-Met  88.33 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0042  tRNA-Met  88.33 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0016  tRNA-Met  88.33 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000174645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0019  tRNA-Met  88.33 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000626399  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14007  tRNA-Met  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0236309 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0041  tRNA-Met  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0008  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0008  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0077  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0005  tRNA-Met  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0023  tRNA-Met  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00191996  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt021  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000111165  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0078  tRNA-Met  85.14 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376289  normal  0.616064 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0744  tRNA-Met  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0024  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000329716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1228  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2266  tRNA-Met  87.93 
 
 		 79 bp  60  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.507582  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2151  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0974821  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0012  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178155  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0011  tRNA-Met  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0037  tRNA-Met  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0060  tRNA-Met  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0051  tRNA-Met  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00732505  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0053  tRNA-Met  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.157606  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0046  tRNA-Met  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00480541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0039  tRNA-Met  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0045  tRNA-Met  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t1753  tRNA-OTHER  93.94 
 
 		 61 bp  50.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0016922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0029  tRNA-Met  88.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.513639 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0017  tRNA-Met  91.89 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000739472  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07660  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5705  tRNA-Asx  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918639  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0050  tRNA-Met  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000143302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0717839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0120777  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000687099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000262097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.449639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R17  tRNA-Met  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0031  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000435649  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0078  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0033  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000091972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0042  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000233042  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0074  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0111  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00999623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0120  tRNA-Asn  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>