198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_R0031 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_R0026  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000025046  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0031  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000375909  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0078  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0027  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000161448  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0031  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000435649  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0078  tRNA-Asn  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  98.67 
 
 
75 bp  141  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0111  tRNA-Asn  98.59 
 
 
75 bp  133  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00999623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5647  tRNA-Asx  98.59 
 
 
75 bp  133  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5656  tRNA-Asx  98.59 
 
 
75 bp  133  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5705  tRNA-Asx  98.59 
 
 
75 bp  133  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0074  tRNA-Asn  98.59 
 
 
75 bp  133  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5713  tRNA-Asx  98.59 
 
 
75 bp  133  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.423008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4560  tRNA-Glu  98.59 
 
 
153 bp  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000215336  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0188  tRNA-Asn  98.59 
 
 
77 bp  133  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  98.59 
 
 
78 bp  133  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  98.59 
 
 
78 bp  133  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0717839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  98.59 
 
 
78 bp  133  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0120777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  98.59 
 
 
78 bp  133  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000216624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0231  tRNA-Asn  98.59 
 
 
77 bp  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00193561  normal 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  98.59 
 
 
78 bp  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000264792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  98.59 
 
 
78 bp  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  98.59 
 
 
78 bp  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  98.59 
 
 
78 bp  133  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00125687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  98.59 
 
 
78 bp  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000687099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  98.59 
 
 
78 bp  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000262097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  98.59 
 
 
78 bp  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.449639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  98.59 
 
 
78 bp  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0871  tRNA-Glu  98.59 
 
 
153 bp  133  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  98.59 
 
 
75 bp  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  98.59 
 
 
75 bp  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  98.59 
 
 
75 bp  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000965695  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  98.59 
 
 
75 bp  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0120  tRNA-Asn  98.59 
 
 
75 bp  133  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0167  tRNA-Asn  98.59 
 
 
77 bp  133  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641958 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0269  tRNA-Asn  98.59 
 
 
77 bp  133  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5663  tRNA-Asn  98.59 
 
 
77 bp  133  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000092576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5650  tRNA-Asn  98.59 
 
 
77 bp  133  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000564406  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4984  tRNA-Asn  98.59 
 
 
77 bp  133  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0796  tRNA-Glu  98.59 
 
 
153 bp  133  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.41258e-33 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5053  tRNA-Asn  98.59 
 
 
77 bp  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000166826  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0042  tRNA-Asn  98.59 
 
 
75 bp  133  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000134576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0124  tRNA-Asn  98.59 
 
 
75 bp  133  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0291  tRNA-Asn  98.59 
 
 
77 bp  133  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0115  tRNA-Asn  98.59 
 
 
75 bp  133  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5743  tRNA-Glu  98.59 
 
 
77 bp  133  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000765198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5015  tRNA-Asn  98.59 
 
 
77 bp  133  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0225437  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0033  tRNA-Asn  98.59 
 
 
75 bp  133  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000091972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5800  tRNA-Asn  98.59 
 
 
77 bp  133  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00845439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0042  tRNA-Asn  98.53 
 
 
72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000233042  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  97.18 
 
 
75 bp  125  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  97.18 
 
 
75 bp  125  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5706  tRNA-Asn  95.77 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000905345  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5671  tRNA-Asx  95.77 
 
 
75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  95.77 
 
 
78 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000140923  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  95.77 
 
 
78 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.043106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0077  tRNA-Asn  95.77 
 
 
75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000930167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  95.77 
 
 
78 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000206575  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  95.77 
 
 
75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000655937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0524  tRNA-Asn  95.77 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4385300000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5148  tRNA-Asn  95.77 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  normal  0.479478 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4777  tRNA-Asn  95.77 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000213851  hitchhiker  0.0000000000000219436 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0600  tRNA-Asn  95.77 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000379275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0033  tRNA-Asn  95.77 
 
 
75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.104706  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0015  tRNA-Asn  92.65 
 
 
72 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0005  tRNA-Asn  92.65 
 
 
72 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.570068 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0014  tRNA-Asn  92.65 
 
 
72 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0038  tRNA-Asn  91.55 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0032  tRNA-Asn  91.55 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0117  tRNA-Asn  91.55 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_714  tRNA-Asn  90 
 
 
75 bp  83.8  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0692708  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0022  tRNA-Asn  90 
 
 
75 bp  83.8  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.275054  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0025  tRNA-Asn  89.71 
 
 
72 bp  79.8  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.691429  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0043  tRNA-Asn  94.12 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  88.57 
 
 
75 bp  75.8  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00645597  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0056  tRNA-Asn  93.1 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0090  tRNA-Asn  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0054  tRNA-Asn  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0042  tRNA-Asn  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0029  tRNA-Asn  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0083  tRNA-Asn  88.24 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233313  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAsnVIMSS1309370  tRNA-Asn  92.16 
 
 
72 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0030  tRNA-Asn  92.16 
 
 
72 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0052  tRNA-Asn  87.32 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.274445  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAsnVIMSS1309217  tRNA-Asn  92.16 
 
 
72 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0041  tRNA-Asn  87.32 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000401156  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0032  tRNA-Asn  87.32 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118975  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  89.47 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0500  tRNA-Asn  89.47 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00327724  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  86.96 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0044  tRNA-Asn  90.57 
 
 
72 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0403004  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0531  tRNA-Asn  89.47 
 
 
72 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1748  tRNA-Asn  89.47 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0036  tRNA-Asn  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0002  tRNA-Asn  91.07 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0008  tRNA-Asn  89.29 
 
 
72 bp  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0039  tRNA-Asn  85.92 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092174  hitchhiker  0.00180785 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0029  tRNA-Asn  85.92 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0127801  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0018  tRNA-Asn  85.92 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723624  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0035  tRNA-Asn  91.3 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>