284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2793 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0001  50S ribosomal protein L34  100 
 
 
45 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000166725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2793  50S ribosomal protein L34  100 
 
 
45 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.202877  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  90.91 
 
 
44 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 
44 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 
44 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 
44 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5341  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 
44 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000589989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 
44 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5281  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 
44 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5738  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 
44 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0731881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 
44 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5598  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 
44 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 
44 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5615  50S ribosomal protein L34  88.64 
 
 
44 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106423  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1944  50S ribosomal protein L34  79.55 
 
 
44 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00370795  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2065  50S ribosomal protein L34  81.82 
 
 
44 aa  68.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000217746  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1898  ribosomal protein L34  79.55 
 
 
54 aa  68.2  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000611674  hitchhiker  3.5180100000000004e-26 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1864  50S ribosomal protein L34P  79.55 
 
 
44 aa  67.4  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.670126  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2950  ribosomal protein L34  77.27 
 
 
44 aa  63.5  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000318423  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1793  50S ribosomal protein L34  75 
 
 
44 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000343039  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1787  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 
44 aa  62  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000418324  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  74.42 
 
 
48 aa  62  0.000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
48 aa  61.2  0.000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 
52 aa  60.8  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  66.67 
 
 
52 aa  60.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000022911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4370  ribosomal protein L34  75 
 
 
44 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.09492  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0870  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.1  0.000000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 
44 aa  60.1  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682.1  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
44 aa  60.1  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3946  50S ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4225  ribosomal protein L34  66.67 
 
 
45 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2935  ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000367166  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  69.77 
 
 
44 aa  58.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3379  ribosomal protein L34  64.44 
 
 
45 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 
44 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5415  50S ribosomal protein L34  64.44 
 
 
45 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3760  50S ribosomal protein L34P  69.05 
 
 
44 aa  58.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4868  ribosomal protein L34  63.64 
 
 
47 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000339328  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  69.77 
 
 
52 aa  57.8  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2161  50S ribosomal protein L34  62.22 
 
 
45 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9389  50S ribosomal protein L34P  64.44 
 
 
45 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0319883  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4138  ribosomal protein L34  66.67 
 
 
45 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00368218  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 
44 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2414  50S ribosomal protein L34  73.81 
 
 
44 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000429596  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38060  LSU ribosomal protein L34P  62.22 
 
 
49 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5096  ribosomal protein L34  64.44 
 
 
45 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  69.77 
 
 
52 aa  57.4  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4700  50S ribosomal protein L34P  64.44 
 
 
45 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271583  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3730  ribosomal protein L34  62.22 
 
 
49 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.458139 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
44 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3117  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 
47 aa  57  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116193  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0132  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 
44 aa  57  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  65.91 
 
 
51 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 
47 aa  57  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2558  ribosomal protein L34  63.64 
 
 
45 aa  57  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000028537  normal  0.271528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  65.91 
 
 
44 aa  57  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 
44 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 
46 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0092  ribosomal protein L34  70.45 
 
 
44 aa  56.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9056  ribosomal protein L34  62.22 
 
 
45 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00101546  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0220  50S ribosomal protein L34P  65.91 
 
 
51 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2743  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 
53 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3898  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
44 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.035137  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2924  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 
53 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916972  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  65.12 
 
 
44 aa  55.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4548  50S ribosomal protein L34  60 
 
 
45 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0003403  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13959  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 
47 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4487  ribosomal protein L34  63.64 
 
 
44 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849089  hitchhiker  0.00000000110171 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4513  ribosomal protein L34  60 
 
 
45 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  62.79 
 
 
44 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 
44 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  62.79 
 
 
44 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 
44 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 
44 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27040  LSU ribosomal protein L34P  60 
 
 
45 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  65.12 
 
 
55 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 
46 aa  55.1  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 
44 aa  55.1  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  65.12 
 
 
44 aa  54.3  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6487  50S ribosomal protein L34  57.78 
 
 
45 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00156279  normal  0.0851435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7100  ribosomal protein L34  62.79 
 
 
47 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161616  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 
53 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 
51 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1540  ribosomal protein L34  63.64 
 
 
44 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000041199  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7341  50S ribosomal protein L34  57.78 
 
 
45 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4172  50S ribosomal protein L34  62.22 
 
 
45 aa  53.9  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000696082  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2238  ribosomal protein L34  63.64 
 
 
44 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.773424  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 
46 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 
46 aa  53.9  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  61.36 
 
 
44 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  62.79 
 
 
52 aa  53.9  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 
44 aa  53.9  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2338  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 
53 aa  53.5  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_002950  PG0656  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 
50 aa  53.1  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.244963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0082  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 
44 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.376077 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1369  ribosomal protein L34  75 
 
 
44 aa  53.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.510179  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2038  ribosomal protein L34  61.36 
 
 
44 aa  52.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0100  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 
53 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2577  50S ribosomal protein L34  59.09 
 
 
44 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  65.12 
 
 
53 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>