196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2792 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  100 
 
 
117 aa  234  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  100 
 
 
117 aa  234  3e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  82.61 
 
 
115 aa  192  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  52.83 
 
 
121 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  48.18 
 
 
111 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  50.94 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  50.94 
 
 
115 aa  107  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  50.94 
 
 
119 aa  107  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  50.94 
 
 
119 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  50.94 
 
 
119 aa  107  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  50.94 
 
 
119 aa  107  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  50.94 
 
 
119 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  50 
 
 
115 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  50 
 
 
115 aa  105  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  50.94 
 
 
115 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  47.62 
 
 
116 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  42.86 
 
 
117 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  48.11 
 
 
115 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  49.53 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  46.02 
 
 
122 aa  96.7  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  42.98 
 
 
117 aa  90.5  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  44.63 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  40.35 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  40.35 
 
 
116 aa  80.9  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  39.62 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  32.17 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  35.14 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  35 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  35 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  36.19 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  38.54 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  35.58 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  35.09 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  32.41 
 
 
126 aa  67  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  38.53 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  43.68 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  35.24 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  31.19 
 
 
115 aa  63.5  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  32.43 
 
 
111 aa  62.8  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  34.62 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  30.19 
 
 
162 aa  61.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  32.99 
 
 
114 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  35.92 
 
 
116 aa  60.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  32.29 
 
 
118 aa  60.5  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000477039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  32.76 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  32.76 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  34.55 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  46.05 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  34.29 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  34.12 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  30.63 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000742435  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  32.26 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  34.12 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000192203  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  30.19 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  30.21 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  34 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  29.21 
 
 
180 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  46.15 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3320  ribonuclease P protein component  27.45 
 
 
120 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  45.83 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  29.17 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  30.77 
 
 
162 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  35 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  29.79 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  27.68 
 
 
119 aa  54.3  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  39.08 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  25.89 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3035  ribonuclease P protein component  27.45 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  27.19 
 
 
123 aa  52.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000948284  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  31.43 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  30.43 
 
 
119 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3897  ribonuclease P protein component  32.69 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590207  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  29.46 
 
 
116 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  31.03 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3076  hypothetical protein  32.46 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4931  ribonuclease P  27.88 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000059586  unclonable  0.00000000749508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  26.13 
 
 
118 aa  50.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  29.2 
 
 
126 aa  50.4  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  26.67 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2932  hypothetical protein  33.66 
 
 
114 aa  50.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3609  ribonuclease P protein component  26.42 
 
 
118 aa  50.1  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  38.64 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  31.03 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  31.03 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1919  ribonuclease P protein component  42 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.100919  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  27.78 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0004  ribonuclease P  27.88 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000936038  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  37.5 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2390  ribonuclease P protein component  30.17 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102633  hitchhiker  0.0000000753131 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4486  ribonuclease P protein component  30.93 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000175876  hitchhiker  0.00000000129187 
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  28.04 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4065  ribonuclease P  26.55 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000140717  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1265  ribonuclease P protein component  36.84 
 
 
127 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000149389  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4508  ribonuclease P protein component  47.73 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  29.63 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>