163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2607 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2555  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  100 
 
 
226 aa  454  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2607  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  100 
 
 
226 aa  454  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2095  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  78.22 
 
 
227 aa  346  2e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1074  L-serine ammonia-lyase  40.55 
 
 
220 aa  160  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000107918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1075  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  52.23 
 
 
220 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102707  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5571  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  46.54 
 
 
232 aa  155  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.244703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3068  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit beta  45.91 
 
 
232 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.65769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3288  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  45.91 
 
 
232 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3308  l-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit beta  45.91 
 
 
232 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.826727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2835  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  40.35 
 
 
220 aa  155  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2482  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  44.59 
 
 
232 aa  152  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0887  L-serine ammonia-lyase  47.13 
 
 
223 aa  148  6e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0556305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1965  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  47.77 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0988  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  37.28 
 
 
220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4209  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  36.84 
 
 
219 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3885  L-serine dehydratase subunit beta  36.84 
 
 
219 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3893  L-serine dehydratase, beta subunit  36.84 
 
 
219 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4162  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  36.84 
 
 
219 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4272  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  36.84 
 
 
220 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3971  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  45.86 
 
 
220 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4248  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  36.84 
 
 
220 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2145  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  50 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4047  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit beta  45.22 
 
 
219 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4361  l-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit beta  45.22 
 
 
219 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1282  L-serine dehydratase beta subunit  46.84 
 
 
223 aa  137  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.38968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1252  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  38.5 
 
 
221 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.809325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16340  L-serine ammonia-lyase, beta subunit  47.02 
 
 
218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1245  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  42 
 
 
226 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0325404  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1057  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  42 
 
 
226 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1420  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  37.38 
 
 
222 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2642  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  44.37 
 
 
226 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1507  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  46.36 
 
 
220 aa  119  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000296361  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1947  L-serine ammonia-lyase  43.05 
 
 
218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.376252  hitchhiker  0.000000222078 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2959  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  44.37 
 
 
226 aa  118  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2064  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  37.91 
 
 
224 aa  118  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293764  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1760  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  35.35 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.178826  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2853  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  43.28 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0221158 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0503  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  37.91 
 
 
549 aa  116  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.742023 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1460  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  33.18 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717015  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0266  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.22 
 
 
224 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10070  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit/L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  36.67 
 
 
541 aa  108  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000332749  hitchhiker  0.0000000458611 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16320  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit/L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  38.55 
 
 
552 aa  108  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  hitchhiker  0.00195001 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0199  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  36.61 
 
 
216 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000476395  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1332  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  31.51 
 
 
221 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385667  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0097  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  35.27 
 
 
220 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000599373  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0336  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.91 
 
 
216 aa  103  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.866527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3836  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  43.33 
 
 
223 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0141316  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1475  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.06 
 
 
220 aa  99  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0952  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  41.22 
 
 
536 aa  96.7  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235834 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1548  serine dehydratase alpha chain  30.08 
 
 
519 aa  61.6  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000153411  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5758  L-serine dehydratase 1  29.38 
 
 
475 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.302413 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1195  L-serine dehydratase 1  32.45 
 
 
477 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197277  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1196  L-serine ammonia-lyase  32.45 
 
 
477 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.741628  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1806  L-serine dehydratase 1  30.67 
 
 
458 aa  52.4  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1902  L-serine dehydratase  32 
 
 
455 aa  52  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.457679  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0288  L-serine ammonia-lyase  32 
 
 
455 aa  52  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0239  L-serine dehydratase 1  30.97 
 
 
475 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.180472  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0920  L-serine ammonia-lyase  32.03 
 
 
458 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2900  L-serine dehydratase 1  26.88 
 
 
458 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2740  serine dehydratase alpha chain  38.16 
 
 
460 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000127179  hitchhiker  0.000000403127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4357  L-serine dehydratase 1  29.41 
 
 
462 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3319  L-serine ammonia-lyase  27.56 
 
 
557 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0141  L-serine dehydratase 1  27.27 
 
 
462 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0129  L-serine dehydratase 1  27.27 
 
 
462 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0527  L-serine dehydratase 1  29.79 
 
 
459 aa  49.3  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6242  L-serine dehydratase 1  32.16 
 
 
482 aa  48.9  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679058  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0155  L-serine dehydratase 1  26.62 
 
 
462 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3483  L-serine ammonia-lyase  27.27 
 
 
458 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2913  L-serine dehydratase 1  26.62 
 
 
462 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0142  L-serine dehydratase 1  26.62 
 
 
462 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2570  L-serine dehydratase 1  27.45 
 
 
458 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3740  L-serine dehydratase 1  44.74 
 
 
453 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.205833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3144  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  26.8 
 
 
458 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3598  L-serine ammonia-lyase  30 
 
 
454 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.842995  normal  0.929959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0654  L-serine dehydratase 1  29.61 
 
 
462 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344045  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3502  L-serine ammonia-lyase  30 
 
 
454 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4035  L-serine dehydratase 1  43.24 
 
 
453 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1084  L-serine dehydratase 1  27.1 
 
 
472 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0982  L-serine ammonia-lyase  27.33 
 
 
459 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3431  L-serine ammonia-lyase  40.74 
 
 
454 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3535  L-serine ammonia-lyase  29.33 
 
 
454 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0139  L-serine dehydratase 1  25.97 
 
 
462 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0518  L-serine dehydratase 1  30.32 
 
 
457 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2991  L-serine ammonia-lyase  26.45 
 
 
462 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3522  Iron-sulfur-dependent L-serine dehydratase single chain form  31.82 
 
 
458 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540512  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3314  L-serine ammonia-lyase  26.45 
 
 
462 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1546  L-serine ammonia-lyase  26.45 
 
 
462 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4002  L-serine ammonia-lyase  26.45 
 
 
462 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3056  L-serine ammonia-lyase  26.45 
 
 
462 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.541658  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3428  L-serine ammonia-lyase  29.33 
 
 
454 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6165  L-serine dehydratase  25.75 
 
 
485 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2711  L-serine dehydratase 1  26.14 
 
 
458 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.468733 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0131  L-serine ammonia-lyase  26.45 
 
 
462 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3931  L-serine ammonia-lyase  26.45 
 
 
462 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.706313  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3250  L-serine dehydratase 1  41.67 
 
 
455 aa  45.8  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.648772  normal  0.619841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1149  L-serine dehydratase 1  27.45 
 
 
499 aa  45.8  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1325  L-serine ammonia-lyase  31.67 
 
 
458 aa  45.4  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.138393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3321  L-serine ammonia-lyase  26.62 
 
 
462 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3251  L-serine ammonia-lyase  26.45 
 
 
462 aa  45.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3333  L-serine ammonia-lyase  26.71 
 
 
458 aa  45.1  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>