142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2515 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  83.42 
 
 
609 aa  1050    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  59.44 
 
 
608 aa  704    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  59.28 
 
 
608 aa  699    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  60.45 
 
 
585 aa  689    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  100 
 
 
609 aa  1231    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  100 
 
 
609 aa  1231    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  56.16 
 
 
608 aa  680    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  59.11 
 
 
608 aa  705    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  59.28 
 
 
608 aa  700    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  59.44 
 
 
608 aa  739    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  59.44 
 
 
608 aa  738    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  58.95 
 
 
608 aa  703    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  58.46 
 
 
608 aa  710    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  47.72 
 
 
612 aa  540  9.999999999999999e-153  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  43.74 
 
 
614 aa  521  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  44.48 
 
 
615 aa  515  1e-144  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  47.97 
 
 
614 aa  514  1e-144  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  44.03 
 
 
611 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  41.6 
 
 
636 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  44.81 
 
 
612 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  40.9 
 
 
614 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  40.26 
 
 
614 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  63.9 
 
 
365 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  42.23 
 
 
629 aa  442  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  39.62 
 
 
627 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  40.81 
 
 
615 aa  445  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  40.13 
 
 
611 aa  438  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  41.91 
 
 
629 aa  438  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  41.63 
 
 
672 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  38.97 
 
 
693 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  40.45 
 
 
627 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  37.97 
 
 
781 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  38.6 
 
 
674 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  36.82 
 
 
683 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  36.52 
 
 
668 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  36.32 
 
 
658 aa  388  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  36.53 
 
 
654 aa  388  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  34.99 
 
 
677 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  34.82 
 
 
731 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  36.6 
 
 
672 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  36.76 
 
 
685 aa  385  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  37.36 
 
 
672 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  37.68 
 
 
696 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  36.13 
 
 
750 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  36.09 
 
 
674 aa  375  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  35.96 
 
 
682 aa  371  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  34.74 
 
 
664 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  37.93 
 
 
691 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  35.7 
 
 
655 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  37.77 
 
 
653 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  35.83 
 
 
664 aa  363  6e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  35.67 
 
 
664 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  35.67 
 
 
664 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  34.86 
 
 
657 aa  360  4e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  35.03 
 
 
704 aa  359  7e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  34.79 
 
 
664 aa  354  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  35.64 
 
 
667 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  35.74 
 
 
678 aa  353  7e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  35.61 
 
 
681 aa  352  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  36.44 
 
 
619 aa  350  5e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  36.81 
 
 
615 aa  344  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  37 
 
 
677 aa  344  2.9999999999999997e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  36.21 
 
 
678 aa  344  2.9999999999999997e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  35.51 
 
 
667 aa  342  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  33.22 
 
 
647 aa  317  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  34.35 
 
 
622 aa  310  5e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  31.83 
 
 
774 aa  301  3e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.12 
 
 
815 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.47 
 
 
777 aa  281  3e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1726  amino acid permease, C-terminal  54.58 
 
 
272 aa  280  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0922786  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  39.73 
 
 
470 aa  259  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  60.66 
 
 
253 aa  248  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  30.48 
 
 
713 aa  209  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  30.48 
 
 
713 aa  209  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1748  hypothetical protein  48.4 
 
 
218 aa  207  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0151353  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  27.59 
 
 
650 aa  197  6e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  31.25 
 
 
657 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  31.71 
 
 
656 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  31.81 
 
 
657 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  29.49 
 
 
647 aa  174  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  29.49 
 
 
647 aa  174  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  28.57 
 
 
680 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  28.07 
 
 
685 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  27.53 
 
 
680 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1724  amino acid permease, N-terminal  60.61 
 
 
101 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  26.89 
 
 
657 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 
657 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 
655 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1492  amino acid permease-associated region  24.61 
 
 
431 aa  68.9  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.993916  normal  0.460323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3899  hypothetical protein  28.52 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.823757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3973  hypothetical protein  28.52 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.460443  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3914  hypothetical protein  28.52 
 
 
448 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  26.32 
 
 
455 aa  65.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0162  amino acid transporter  22.88 
 
 
755 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  24.36 
 
 
521 aa  63.9  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295081  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0608  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 
444 aa  62  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26378  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2156  amino acid transporters  23.43 
 
 
746 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.739886  normal  0.876305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  26.88 
 
 
472 aa  50.8  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  23.94 
 
 
460 aa  50.4  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0920  Amino acid transporter-like  23.19 
 
 
619 aa  50.4  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000519212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>