More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2490 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2490  phosphoglyceromutase  100 
 
 
228 aa  472  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2442  phosphoglyceromutase  100 
 
 
228 aa  472  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2007  phosphoglyceromutase  81.14 
 
 
228 aa  389  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  57.78 
 
 
229 aa  284  7e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  57.46 
 
 
230 aa  280  2e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  56.44 
 
 
228 aa  271  6e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0382  phosphoglyceromutase  54.39 
 
 
233 aa  263  1e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000158112  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  54.39 
 
 
248 aa  263  2e-69  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  55.75 
 
 
227 aa  263  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  55.31 
 
 
249 aa  261  8.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0179  phosphoglycerate mutase 1 family  58.85 
 
 
229 aa  260  1e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00124281  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0764  phosphoglyceromutase  52.63 
 
 
230 aa  258  4e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00177418  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  53.51 
 
 
230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  54.87 
 
 
249 aa  258  7e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  55.75 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  53.19 
 
 
237 aa  252  3e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  55.31 
 
 
249 aa  252  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  55.32 
 
 
237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  51.75 
 
 
247 aa  251  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  48.67 
 
 
247 aa  251  8.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  51.32 
 
 
247 aa  251  8.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  53.07 
 
 
247 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  50.44 
 
 
248 aa  249  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  51.75 
 
 
249 aa  249  3e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1794  phosphoglyceromutase  52.63 
 
 
245 aa  248  7e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.525097  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  51.75 
 
 
247 aa  248  7e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  52.63 
 
 
333 aa  247  9e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  50.88 
 
 
248 aa  247  9e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  52.19 
 
 
245 aa  247  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1264  phosphoglyceromutase  54.39 
 
 
230 aa  247  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.500435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  51.75 
 
 
245 aa  246  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  51.75 
 
 
234 aa  246  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 
249 aa  246  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  51.53 
 
 
248 aa  246  3e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  50.44 
 
 
247 aa  245  4e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6148  phosphoglyceromutase  53.95 
 
 
245 aa  245  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.334482  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 
247 aa  244  6.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  51.32 
 
 
245 aa  244  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  50.44 
 
 
234 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2893  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00820625  normal  0.311861 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 
245 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  51.32 
 
 
245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  50.44 
 
 
247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  51.32 
 
 
245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  51.32 
 
 
245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  50.44 
 
 
245 aa  242  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  51.75 
 
 
251 aa  242  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  50 
 
 
270 aa  241  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  50 
 
 
270 aa  241  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  50 
 
 
248 aa  241  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  49.56 
 
 
247 aa  241  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  50.44 
 
 
247 aa  241  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  50 
 
 
248 aa  241  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  50 
 
 
248 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  50 
 
 
247 aa  241  9e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  49.56 
 
 
270 aa  240  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  50.44 
 
 
247 aa  240  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  51.33 
 
 
249 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  49.56 
 
 
248 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  49.56 
 
 
250 aa  240  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  51.35 
 
 
229 aa  239  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  50 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  49.56 
 
 
248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  49.12 
 
 
436 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  53.07 
 
 
232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  50.22 
 
 
270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  49.56 
 
 
293 aa  238  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  49.12 
 
 
240 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  51.09 
 
 
247 aa  237  9e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  49.56 
 
 
247 aa  237  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3265  phosphoglyceromutase  50 
 
 
228 aa  237  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.602214  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  53.39 
 
 
248 aa  237  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  48.91 
 
 
267 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 
249 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 
249 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 
249 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  49.56 
 
 
245 aa  236  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 
249 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 
249 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 
249 aa  236  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 
249 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  49.78 
 
 
246 aa  235  4e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  48.68 
 
 
248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  52.75 
 
 
251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 
247 aa  234  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  48.68 
 
 
247 aa  234  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  48.68 
 
 
250 aa  234  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  49.12 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  48.23 
 
 
250 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  52.27 
 
 
247 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  48.23 
 
 
250 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  48.67 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  49.34 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  49.56 
 
 
228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  49.56 
 
 
229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  46.9 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  52.53 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  50.44 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  50.91 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  47.81 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>