More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2487 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
259 aa  517  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
259 aa  517  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2005  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  81.54 
 
 
262 aa  439  1e-122  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.01 
 
 
257 aa  238  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.01 
 
 
257 aa  238  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  48.31 
 
 
265 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  46.61 
 
 
257 aa  235  5e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  48.12 
 
 
265 aa  233  2e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  47.74 
 
 
265 aa  233  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3698  extracellular solute-binding protein family 3  42.41 
 
 
256 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  47.74 
 
 
265 aa  231  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  47.74 
 
 
265 aa  231  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  47.74 
 
 
265 aa  231  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  47.74 
 
 
265 aa  231  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  47.74 
 
 
265 aa  231  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  47.74 
 
 
265 aa  231  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  47.74 
 
 
265 aa  231  7e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  45.88 
 
 
260 aa  231  8e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  48.12 
 
 
265 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  43.19 
 
 
256 aa  230  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0235  extracellular solute-binding protein family 3  45.53 
 
 
255 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  44.36 
 
 
255 aa  229  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  46.96 
 
 
260 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3156  extracellular solute-binding protein  48.47 
 
 
260 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  48.47 
 
 
260 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  48.47 
 
 
260 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4163  extracellular solute-binding protein family 3  46.86 
 
 
257 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0212  amino acid ABC transporter, substrate-binding  44.23 
 
 
260 aa  226  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  47.39 
 
 
257 aa  226  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  46.49 
 
 
257 aa  225  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3835  extracellular solute-binding protein family 3  46.41 
 
 
257 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2686  extracellular solute-binding protein family 3  43.46 
 
 
260 aa  221  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1126  extracellular solute-binding protein family 3  47.79 
 
 
271 aa  221  1e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.390537  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4924  extracellular solute-binding protein  45.06 
 
 
261 aa  220  2e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1432  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  43.46 
 
 
260 aa  220  2e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0207  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.73 
 
 
260 aa  214  1e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.670956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2345  extracellular solute-binding protein  46.72 
 
 
273 aa  212  4e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.949438  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.68 
 
 
503 aa  211  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1928  extracellular solute-binding protein  39.35 
 
 
278 aa  211  8e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4150  extracellular solute-binding protein family 3  46.22 
 
 
268 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  41.39 
 
 
257 aa  210  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  4.35982e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1150  extracellular solute-binding protein  39.05 
 
 
281 aa  209  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1925  solute-binding family 1 protein  44.8 
 
 
250 aa  208  7e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.6 
 
 
503 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.68 
 
 
489 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  38.68 
 
 
489 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.68 
 
 
489 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0781  amino-acid ABC transporter extracellular-binding protein yckK  39.92 
 
 
252 aa  194  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1924  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  38.89 
 
 
259 aa  194  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1758  hook assembly protein, flagella  40.8 
 
 
250 aa  190  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  3.45404e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1926  solute-binding family 1 protein  41.52 
 
 
250 aa  188  8e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0790  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.24 
 
 
483 aa  179  3e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.124129  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  35.18 
 
 
266 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  36.88 
 
 
265 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  34.12 
 
 
266 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  36.91 
 
 
266 aa  155  5e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  36.68 
 
 
253 aa  155  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  37.07 
 
 
266 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  36.64 
 
 
266 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.84 
 
 
267 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  36.64 
 
 
266 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  36.64 
 
 
266 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 
270 aa  152  6e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 
266 aa  152  6e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  1.79971e-09 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  39.06 
 
 
264 aa  152  6e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.2 
 
 
264 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  39.06 
 
 
264 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.2 
 
 
264 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  39.06 
 
 
264 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.2 
 
 
264 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.2 
 
 
264 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 
264 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  39.06 
 
 
264 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.2 
 
 
284 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.2 
 
 
264 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.2 
 
 
264 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.5 
 
 
264 aa  151  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  38.63 
 
 
264 aa  151  9e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 
270 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  38.2 
 
 
264 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 
266 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 
266 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.2 
 
 
266 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  37.66 
 
 
285 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  37.66 
 
 
266 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  37.33 
 
 
263 aa  148  9e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  37.77 
 
 
264 aa  147  2e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.07 
 
 
264 aa  147  2e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  37.23 
 
 
266 aa  146  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  36.64 
 
 
268 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  37.23 
 
 
285 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  36.8 
 
 
266 aa  145  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  36.8 
 
 
266 aa  145  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  33.72 
 
 
266 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  36.8 
 
 
266 aa  145  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  36.36 
 
 
266 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  36.36 
 
 
266 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  4.88454e-05 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  36.36 
 
 
266 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  5.83389e-11 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  35.06 
 
 
266 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  35.06 
 
 
315 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>