More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2452 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1972  AraC family transcriptional regulator  58.06 
 
 
701 aa  851    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000433091  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2405  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 
701 aa  1424    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.269245  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2452  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 
701 aa  1424    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0494728  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0706  helix-turn-helix domain-containing protein  21.39 
 
 
716 aa  95.1  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0691  helix-turn-helix domain-containing protein  21.39 
 
 
716 aa  95.1  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0320  AraC family transcriptional regulator  23.92 
 
 
724 aa  89.7  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.804033  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  26.69 
 
 
745 aa  73.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  26.69 
 
 
745 aa  73.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3152  sigma-54 factor, interaction region  30.77 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  23.35 
 
 
305 aa  66.6  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211757 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  23.81 
 
 
310 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  23.81 
 
 
310 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 
356 aa  66.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  23.81 
 
 
310 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 
277 aa  65.5  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03989  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.25 
 
 
302 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3874  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 
302 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4584  DNA-binding transcriptional regulator MelR  31.25 
 
 
302 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.781071  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03950  hypothetical protein  31.25 
 
 
302 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4359  DNA-binding transcriptional regulator MelR  31.25 
 
 
302 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5632  DNA-binding transcriptional regulator MelR  31.25 
 
 
302 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4643  DNA-binding transcriptional regulator MelR  31.25 
 
 
296 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3909  DNA-binding transcriptional regulator MelR  31.25 
 
 
302 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4643  DNA-binding transcriptional regulator MelR  31.25 
 
 
296 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4552  DNA-binding transcriptional regulator MelR  31.25 
 
 
296 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316037  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4615  DNA-binding transcriptional regulator MelR  31.25 
 
 
302 aa  64.7  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4692  DNA-binding transcriptional regulator MelR  31.25 
 
 
296 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.887715  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4561  DNA-binding transcriptional regulator MelR  31.25 
 
 
296 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4672  DNA-binding transcriptional regulator MelR  31.25 
 
 
302 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0396  AraC-like transcriptional regulator  24.6 
 
 
285 aa  64.7  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000261695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  29.92 
 
 
427 aa  63.9  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2765  transcriptional regulator, AraC family  23.01 
 
 
270 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0588178  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  27.45 
 
 
339 aa  63.9  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  24.36 
 
 
314 aa  63.9  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 
304 aa  63.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 
502 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 
276 aa  63.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 
359 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  23.08 
 
 
310 aa  62  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 
345 aa  62  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 
548 aa  61.6  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  23.08 
 
 
310 aa  62  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  27.37 
 
 
299 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0769  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 
266 aa  61.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  30.92 
 
 
273 aa  61.2  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1584  two component AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
259 aa  61.2  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  27.37 
 
 
299 aa  60.8  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2672  AraC family transcriptional regulator  24.21 
 
 
270 aa  60.8  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 
291 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 
773 aa  60.8  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  27.37 
 
 
299 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  27.37 
 
 
299 aa  60.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  27.37 
 
 
299 aa  60.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  22.31 
 
 
293 aa  60.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 
287 aa  60.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 
332 aa  60.1  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2546  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  31.15 
 
 
284 aa  60.1  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 
544 aa  60.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  27.37 
 
 
299 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1945  transcriptional regulator, AraC family  32.37 
 
 
278 aa  59.7  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2858  transcriptional regulator, AraC family  23.53 
 
 
270 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141433  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 
367 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  28.12 
 
 
301 aa  59.3  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2506  transcriptional regulator, AraC family  36.26 
 
 
303 aa  59.7  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 
367 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  30.85 
 
 
316 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  27.08 
 
 
259 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  31.73 
 
 
316 aa  59.7  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.79 
 
 
319 aa  59.3  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  24.31 
 
 
302 aa  59.3  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2471  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 
311 aa  58.9  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0153728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  26 
 
 
296 aa  58.9  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  24.22 
 
 
233 aa  59.3  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  23.24 
 
 
316 aa  58.9  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  30.1 
 
 
303 aa  58.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  32.65 
 
 
365 aa  58.5  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  30.1 
 
 
303 aa  58.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 
332 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 
345 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  30.1 
 
 
303 aa  58.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  30.1 
 
 
303 aa  58.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 
332 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  26.95 
 
 
337 aa  58.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  30.1 
 
 
303 aa  58.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 
245 aa  58.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 
332 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 
409 aa  58.5  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 
337 aa  58.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 
332 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 
332 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 
332 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 
1201 aa  58.5  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 
319 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 
319 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  23.15 
 
 
332 aa  58.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 
319 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 
302 aa  58.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 
299 aa  58.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 
332 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  29.81 
 
 
298 aa  57.8  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>