More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2377 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 318 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  100 
 
 		 318 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  76.11 
 
 		 316 aa  514  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  40.91 
 
 		 304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  40.58 
 
 		 302 aa  239  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  41.56 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  40.65 
 
 		 303 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  40.32 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  40.32 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  40.32 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  39.41 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.36 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.96 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.21 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.64 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.31 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1157  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000266671  hitchhiker  6.72858e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.85 
 
 		 317 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.26 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.18 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1732  transcriptional regulator  38.65 
 
 		 296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0174  transcriptional regulator  34.11 
 
 		 374 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0565386  hitchhiker  0.0000000000000158467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  35.61 
 
 		 374 aa  162  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  35.11 
 
 		 372 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  34.95 
 
 		 333 aa  162  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  35.61 
 
 		 375 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 375 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 375 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  35.61 
 
 		 375 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  35.61 
 
 		 375 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.12 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  35.23 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.46 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  34.63 
 
 		 335 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  33.98 
 
 		 333 aa  159  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.64 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1851  transcriptional regulator  36.14 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  34.85 
 
 		 377 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  34.34 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.41 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  34.34 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  34.34 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  33.66 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.97 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  32.65 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  34.38 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  35.25 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  34.38 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.77 
 
 		 488 aa  152  8e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  34.38 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  34.38 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  34.38 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  31.27 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0332  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 386 aa  147  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0368  hypothetical protein  30.26 
 
 		 435 aa  144  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.1 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.45 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0211  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.52 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0435  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 427 aa  138  8.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0640  transcriptional regulator, putative  31.83 
 
 		 412 aa  138  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1715  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 374 aa  138  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565214 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1438  transcriptional regulator  33 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000544973  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.87 
 
 		 563 aa  132  9e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  35.66 
 
 		 349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1138  transcription attenuator LytR  31.62 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.195072  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1115  hypothetical protein  31.62 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.108667  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.98 
 
 		 512 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.18 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.41 
 
 		 445 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.43 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.39 
 
 		 443 aa  125  7e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0875  LytR family transcription antiterminator  30.49 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0676567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0648  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.49 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.500203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0838  transcription antiterminator, LytR family  30.82 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0680  LytR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 398 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4498  transcription antiterminator, LytR family  30.49 
 
 		 399 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000182536 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.77 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0878  transcription antiterminator, LytR family  30.16 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78734e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0746  LytR family transcription antiterminator  30.16 
 
 		 398 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0694  LytR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 398 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0354301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0783  LytR family transcription antiterminator  30.16 
 
 		 398 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01950  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.37 
 
 		 516 aa  121  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000132864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3856  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.89 
 
 		 451 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0694  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.16 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1360  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.88 
 
 		 436 aa  119  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0946  transcription antiterminator, LytR family  30.16 
 
 		 400 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2873  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.94 
 
 		 475 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.07 
 
 		 490 aa  118  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1875  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.74 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.94 
 
 		 495 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3223  cell envelope-like transcriptional attenuator  34.38 
 
 		 471 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3582  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.5 
 
 		 492 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3347  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  28.79 
 
 		 345 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000255205  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.14 
 
 		 390 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.74 
 
 		 453 aa  116  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>