156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2119 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  719    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  719    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  57.55 
 
 
352 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.275433 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  57.83 
 
 
352 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  57.83 
 
 
352 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  56.98 
 
 
352 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  57.26 
 
 
352 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  57.55 
 
 
352 aa  411  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  57.52 
 
 
343 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  57.55 
 
 
349 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.55 
 
 
334 aa  393  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  49.57 
 
 
344 aa  344  1e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  44.35 
 
 
359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  45.66 
 
 
375 aa  285  5.999999999999999e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  43.9 
 
 
385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04350  YeeE/YedE family protein (DUF395)  30.81 
 
 
355 aa  172  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217444 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1655  hypothetical protein  76.24 
 
 
103 aa  163  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000348591  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.94 
 
 
332 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.2 
 
 
330 aa  143  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0151  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.46 
 
 
345 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3909  hypothetical protein  28.24 
 
 
353 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  27.08 
 
 
394 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1028  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.21 
 
 
373 aa  95.1  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.85 
 
 
373 aa  92  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4152  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.93 
 
 
347 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0839918  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.5 
 
 
412 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2872  hypothetical protein  24.59 
 
 
357 aa  89.7  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4968  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.63 
 
 
400 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.06 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  25.2 
 
 
371 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3681  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  24.87 
 
 
366 aa  86.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241689  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3126  YeeE/YedE  23.48 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3774  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.07 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1667  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  24 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2696  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  22.97 
 
 
360 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4379  hypothetical protein  23.45 
 
 
400 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.204255  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2671  hypothetical protein  24.86 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00350575  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3776  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.47 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3665  YeeE/YedE family membrane protein  22.48 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4250  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.22 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.778498  normal  0.233136 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0799  YeeE/YedE  23.63 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236196  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4161  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.59 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4263  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  23.8 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409839  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1528  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.57 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1987  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  24.23 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1287  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.63 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0226086  normal  0.298807 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0045  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.11 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4041  YeeE/YedE  23.67 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.34 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.61 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0829  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.74 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1097  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.49 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.26 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317851  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0739  hypothetical protein  25 
 
 
371 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  21.77 
 
 
415 aa  72  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.19 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  22.28 
 
 
368 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4955  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4366  hypothetical protein  24.04 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1268  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  23.98 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  30.15 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0108  putative inner membrane protein  30.15 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4381  hypothetical protein  27.3 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0111  putative inner membrane protein  30.15 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0107  putative inner membrane protein  30.15 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0112  putative inner membrane protein  30.15 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0732  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.07 
 
 
371 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.90241  normal  0.157208 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0571  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  22.67 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.484751  normal  0.560137 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5899  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  23.66 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0653542  normal  0.677854 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1710  putative inner membrane protein  28.25 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1059  putative inner membrane protein  28.25 
 
 
401 aa  66.2  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000178842  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1717  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.46 
 
 
401 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.697139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0109  putative inner membrane protein  29.41 
 
 
404 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0109  putative inner membrane protein  29.41 
 
 
404 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2029  putative inner membrane protein  36.46 
 
 
401 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2164  putative inner membrane protein  36.46 
 
 
401 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2813  hypothetical protein  23.87 
 
 
362 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2704  putative inner membrane protein  36.46 
 
 
401 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1252  putative inner membrane protein  36.46 
 
 
401 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480893  normal  0.396989 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2201  transmembrane protein  21.51 
 
 
420 aa  64.7  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000866574 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  28.41 
 
 
403 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0829  putative inner membrane protein  32.09 
 
 
406 aa  63.9  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  30 
 
 
404 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19730  putative inner membrane protein  39.36 
 
 
415 aa  63.5  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.18508  normal  0.0148656 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2590  hypothetical protein  34.48 
 
 
455 aa  63.5  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3810  putative inner membrane protein  35.42 
 
 
404 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2122  putative inner membrane protein  34.38 
 
 
401 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1278  putative inner membrane protein  34.38 
 
 
401 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0195044  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2127  putative inner membrane protein  34.38 
 
 
401 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  hitchhiker  0.00000323853 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2180  putative inner membrane protein  34.38 
 
 
401 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113022  normal  0.0595972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1155  putative inner membrane protein  34.38 
 
 
401 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0363195  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0688  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25 
 
 
371 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277778  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0540  YeeE/YedE family protein, putative  21.94 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0115974  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0063  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.51 
 
 
471 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0641  putative inner membrane protein  34.38 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0619351 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3898  putative inner membrane protein  34.38 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0777  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  23.19 
 
 
368 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226768  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1255  TolB periplamsic protein  26.19 
 
 
418 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.588595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.45 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0496  putative inner membrane protein  33.33 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>