40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2087 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2087  phage antirepressor protein  100 
 
 
249 aa  512  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000258428  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2050  phage antirepressor protein  100 
 
 
249 aa  512  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.016924  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0321  phage antirepressor protein  81.6 
 
 
250 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0409481  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0312  phage antirepressor protein  81.6 
 
 
250 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000635944  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1680  phage-encoded protein  48.95 
 
 
239 aa  212  5.999999999999999e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0879  phage antirepressor protein  48.98 
 
 
257 aa  209  5e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00137369  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0585  hypothetical protein  43.7 
 
 
266 aa  186  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000374128  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0647  phage-encoded protein  43.7 
 
 
266 aa  186  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000047659  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  57.14 
 
 
244 aa  161  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  56.83 
 
 
257 aa  156  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  56.83 
 
 
267 aa  155  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  55.46 
 
 
260 aa  143  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0382  phage antirepressor protein, putative  31.22 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000707014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2852  AntA/AntB antirepressor domain protein  31.22 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000203262  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0555  prophage LambdaSa1, antirepressor, putative  32.92 
 
 
249 aa  92.8  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  36.59 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3542  DNA-binding protein Roi  36.69 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  hitchhiker  0.00000000735314 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1070  AntA/AntB family antirepressor  29.17 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0306  DNA-binding protein Roi  38.94 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000394975  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1112  DNA-binding protein Roi  38.94 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000052914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2913  Roi protein  36.51 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00203388  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1435  DNA-binding protein Roi  38.1 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  34.58 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37230  Phage anti-repressor protein AntB-like protein  40.21 
 
 
182 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331791  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01961  hypothetical protein  32.54 
 
 
222 aa  58.9  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0851  AntA/AntB antirepressor domain protein  38.46 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3574  phage anti-repressor protein AntB  33.03 
 
 
217 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000190834 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4001  AntA/AntB antirepressor domain protein  34.55 
 
 
280 aa  55.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1326  hypothetical protein  30.25 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18998  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0817  phage regulatory protein, Rha family  35 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.426302  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1743  AntA/AntB antirepressor domain protein  33.01 
 
 
115 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  31.82 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4350  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  34.09 
 
 
291 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1623  Phage anti-repressor protein-like  34.48 
 
 
247 aa  53.1  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0455176  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  26.97 
 
 
383 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3884  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  32.84 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3591  phage antirepressor protein  34.59 
 
 
251 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0307  putative phage anti-repressor protein  34.78 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.0000000000107558  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0548  phage anti-repressor protein, putative  32.61 
 
 
205 aa  47  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.19591  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0617  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  30.77 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>