20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2078 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2078  RecT protein  100 
 
 
306 aa  630  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2041  RecT protein  100 
 
 
306 aa  630  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0320  RecT protein  99.67 
 
 
306 aa  628  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0329  RecT protein  99.67 
 
 
306 aa  628  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0811  RecT protein  39.75 
 
 
309 aa  175  9e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.481078  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1139  RecT protein  36.33 
 
 
329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2699  rect protein  25.94 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497074  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2617  recombination and repair protein RecT  29.79 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000206281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0604  recombination and repair protein RecT  30.99 
 
 
281 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2507  RecT protein  31.48 
 
 
318 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5094  RecT protein  30.77 
 
 
320 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713826  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0283  RecT family protein  25 
 
 
300 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1916  RecT protein  31.41 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.427469  hitchhiker  0.0000000000811142 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1472  recombination and repair protein RecT  25.19 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.515262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4075  RecT protein  31.29 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1382  recombination and repair protein RecT  25 
 
 
276 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000254024 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2295  RecT protein  29.07 
 
 
269 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133363  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01336  hypothetical protein  29.07 
 
 
269 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01326  recombination and repair protein  29.07 
 
 
269 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1003  RecT protein  24.44 
 
 
303 aa  42.4  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  hitchhiker  0.0000388428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>