46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2062 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2062  HNH endonuclease  100 
 
 
99 aa  201  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0218324  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2025  HNH endonuclease  100 
 
 
99 aa  201  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2705  gp65  49.06 
 
 
111 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.271328  normal  0.759343 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3594  HNH endonuclease  49.06 
 
 
111 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0656  gp65  50 
 
 
112 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1374  gp65  48.11 
 
 
111 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0798155 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1121  HNH endonuclease  41.46 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  40.24 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4388  HNH endonuclease  42.31 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  39.74 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2634  HNH endonuclease  34.21 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017055  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3808  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  39.19 
 
 
120 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4096  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  39.19 
 
 
120 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1077  HNH endonuclease  39.73 
 
 
104 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.687117  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1057  HNH endonuclease  39.73 
 
 
104 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297897  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  39.53 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  36.14 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08210  HNH endonuclease  34.94 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00377503  hitchhiker  0.00349678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  36.14 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0212  HNH nuclease  29.21 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307481  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0240  HNH endonuclease  38.96 
 
 
324 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00719063  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  36.49 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  36.49 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8234  HNH endonuclease  33.77 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0543214  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1636  HNH endonuclease  31.33 
 
 
277 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  38.46 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  31.71 
 
 
81 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5357  hypothetical protein  37.88 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  38.46 
 
 
116 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  40 
 
 
422 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4978  hypothetical protein  37.88 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  34.21 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  30.67 
 
 
587 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  34.21 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  40.96 
 
 
436 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  31.08 
 
 
131 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0017  HNH endonuclease domain protein  36.11 
 
 
144 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  29.89 
 
 
163 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  33.33 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  34.34 
 
 
408 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  32.53 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  31.94 
 
 
221 aa  41.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  35.11 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1967  hypothetical protein  27.27 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3431  Gp54 protein  32.1 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0094955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2505  HNH endonuclease  34.21 
 
 
107 aa  40  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495122  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>