More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2008 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
186 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
186 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  71.2 
 
 
184 aa  286  1e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  57.22 
 
 
182 aa  221  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  57.78 
 
 
182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  56.11 
 
 
182 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  56.11 
 
 
182 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  56.11 
 
 
182 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  55.56 
 
 
182 aa  214  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  56.11 
 
 
182 aa  214  8e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1537  isochorismatase hydrolase  56.98 
 
 
183 aa  213  9e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  55 
 
 
182 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  54.75 
 
 
183 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  56.42 
 
 
182 aa  206  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  54.75 
 
 
181 aa  202  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  53.07 
 
 
184 aa  197  9e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  53.63 
 
 
183 aa  195  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  52.78 
 
 
192 aa  190  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  47.78 
 
 
185 aa  184  6e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0156  isochorismatase hydrolase  48.9 
 
 
182 aa  180  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2104  isochorismatase  57.84 
 
 
102 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1659  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 
180 aa  125  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.262359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0871  isochorismatase hydrolase  39.33 
 
 
178 aa  124  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.317325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  36.31 
 
 
176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 
174 aa  96.7  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0248  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 
193 aa  95.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  33.71 
 
 
174 aa  92.8  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  27.62 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  33.89 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  31.71 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  29.45 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl340  nicotinamidase/pyrazinamidase  32.54 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.148128  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  40 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  32.62 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  34.65 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 
202 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 
201 aa  62.8  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 
214 aa  62.4  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  29.13 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1859  isochorismatase hydrolase  29.13 
 
 
179 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  29.44 
 
 
198 aa  61.2  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3877  isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 
192 aa  61.2  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673276  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0958  isochorismatase hydrolase  27.67 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  29.7 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0828  isochorismatase hydrolase  26.9 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 
237 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4590  isochorismatase family protein  25 
 
 
177 aa  59.3  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5162  isochorismatase hydrolase  28.75 
 
 
203 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0853  isochorismatase hydrolase  33.67 
 
 
194 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0388  conserved hypothetical protein, putative amidase  30.86 
 
 
181 aa  59.3  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0273  amidase  28.24 
 
 
170 aa  58.9  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4511  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 
208 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 
203 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  27 
 
 
213 aa  58.2  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3109  isochorismatase hydrolase  38.57 
 
 
207 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456789  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2374  putative pyrazinamidase / nicotinamidase  25.93 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3544  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  28.89 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3617  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3549  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0918  isochorismatase hydrolase  32.65 
 
 
194 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.509433  normal  0.0420596 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5494  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247983  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5114  isochorismatase hydrolase  29.88 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5203  isochorismatase hydrolase  29.88 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3562  isochorismatase hydrolase  28.97 
 
 
177 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  32.61 
 
 
185 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 
187 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 
187 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  32.5 
 
 
187 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 
179 aa  55.1  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  26.59 
 
 
209 aa  55.1  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  24.04 
 
 
203 aa  54.7  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0547  amidase  31.71 
 
 
161 aa  54.7  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145331  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  36.14 
 
 
235 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3976  isochorismatase hydrolase  23.03 
 
 
178 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  28.26 
 
 
187 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1287  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0906  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.312292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  36.71 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  44.62 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  36.71 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0508  isochorismatase hydrolase  36.78 
 
 
217 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  43.08 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  43.08 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 
200 aa  53.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  43.08 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  25.41 
 
 
193 aa  53.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1368  pyrazinamidase/nicotinamidase  24.38 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>