More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1985 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  73.56 
 
 
456 aa  722    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  100 
 
 
453 aa  944    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  100 
 
 
453 aa  944    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  48.89 
 
 
458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  48.44 
 
 
458 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  48.67 
 
 
458 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  48.55 
 
 
460 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  48.44 
 
 
458 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  48.22 
 
 
458 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  48.44 
 
 
454 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  48.44 
 
 
454 aa  462  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  48.44 
 
 
458 aa  462  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  48.22 
 
 
458 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  48.22 
 
 
458 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  49.89 
 
 
459 aa  458  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  48.12 
 
 
457 aa  458  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  47.61 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  46.48 
 
 
453 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  47.73 
 
 
455 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  47.29 
 
 
455 aa  428  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  46.1 
 
 
459 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  44.96 
 
 
468 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  45.79 
 
 
454 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  42.2 
 
 
456 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  43.5 
 
 
453 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  44.04 
 
 
467 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  43.24 
 
 
459 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  43.47 
 
 
458 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  43.24 
 
 
459 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  43.38 
 
 
459 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  43.38 
 
 
459 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  43.95 
 
 
451 aa  393  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  43.38 
 
 
459 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  43.38 
 
 
459 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  43.38 
 
 
459 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  43.38 
 
 
459 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  43.38 
 
 
459 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  42.66 
 
 
460 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  42.79 
 
 
459 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  43.05 
 
 
464 aa  370  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  40.51 
 
 
453 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  41.97 
 
 
451 aa  362  6e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  38.99 
 
 
457 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  42.38 
 
 
450 aa  353  2.9999999999999997e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0467  RNA methyltransferase, TrmA family  39.02 
 
 
454 aa  352  8e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  40.76 
 
 
458 aa  352  8e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  39.31 
 
 
448 aa  348  2e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  37.25 
 
 
458 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  36.98 
 
 
451 aa  318  1e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  36.53 
 
 
496 aa  316  5e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  35.35 
 
 
465 aa  316  6e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  35.11 
 
 
455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  42.33 
 
 
554 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0423  tRNA methyltransferase, TrmA family  36.98 
 
 
439 aa  314  2.9999999999999996e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  35.08 
 
 
473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  35.65 
 
 
460 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  35.1 
 
 
457 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  38.88 
 
 
438 aa  311  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  35.04 
 
 
461 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  35.04 
 
 
461 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  34.09 
 
 
468 aa  307  3e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  33.97 
 
 
485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  35.31 
 
 
455 aa  297  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  36.45 
 
 
436 aa  297  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0451  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  34.93 
 
 
463 aa  292  8e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.450901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  34.15 
 
 
470 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  34.01 
 
 
493 aa  289  6e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  34.77 
 
 
481 aa  288  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  33.05 
 
 
471 aa  286  7e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  35.44 
 
 
447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  33.48 
 
 
466 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  32.35 
 
 
460 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  38.34 
 
 
401 aa  281  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.368035  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  34.88 
 
 
572 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2487  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  33.92 
 
 
513 aa  276  6e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0134453  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0053  RNA methyltransferase, TrmA family  36.52 
 
 
415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  33.77 
 
 
470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  35.01 
 
 
470 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  33.78 
 
 
462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  30.66 
 
 
489 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  34.48 
 
 
465 aa  264  3e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  33.33 
 
 
479 aa  262  8e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  33.87 
 
 
439 aa  260  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  31.83 
 
 
456 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02120  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  34.47 
 
 
543 aa  258  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  32.14 
 
 
468 aa  257  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0862  RNA methyltransferase, TrmA family  34.08 
 
 
472 aa  256  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  33.87 
 
 
439 aa  256  6e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  30.17 
 
 
488 aa  256  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1583  RNA methyltransferase, TrmA family  33.64 
 
 
446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000730131  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  32.24 
 
 
465 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  31.93 
 
 
451 aa  253  7e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  33.11 
 
 
495 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  33.55 
 
 
471 aa  252  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  32.95 
 
 
462 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  33.18 
 
 
493 aa  250  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  30.18 
 
 
457 aa  249  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  32.3 
 
 
476 aa  249  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14811  SAM-dependent methyltransferase  31.85 
 
 
465 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0686712 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39526  predicted protein  30.12 
 
 
536 aa  249  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.612078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>