More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1720 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01837  aspartyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 
590 aa  656    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1774  aspartyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 
590 aa  656    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0161502  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 
595 aa  712    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
588 aa  1207    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 
594 aa  687    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
588 aa  1207    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 
600 aa  657    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  88.1 
 
 
588 aa  1067    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 
599 aa  656    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 
599 aa  638    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  66.89 
 
 
591 aa  837    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2426  aspartyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 
598 aa  642    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0626295  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 
602 aa  652    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 
583 aa  665    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2060  aspartyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 
590 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0198036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 
591 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  66.21 
 
 
591 aa  832    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  66.21 
 
 
591 aa  831    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  66.21 
 
 
591 aa  830    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
600 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 
593 aa  656    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 
593 aa  656    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
596 aa  652    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 
592 aa  704    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 
599 aa  645    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 
598 aa  655    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  66.72 
 
 
591 aa  836    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 
600 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 
597 aa  659    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2602  aspartyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 
590 aa  659    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.445839  normal  0.911145 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 
598 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 
595 aa  655    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1766  aspartyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 
590 aa  658    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.836624  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  57.88 
 
 
596 aa  710    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 
600 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
600 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0735  aspartyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 
591 aa  647    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000382007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 
594 aa  684    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 
606 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 
596 aa  647    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000708268  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  66.21 
 
 
591 aa  832    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  55.23 
 
 
593 aa  683    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 
590 aa  660    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  66.72 
 
 
589 aa  833    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
588 aa  638    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 
601 aa  651    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 
600 aa  673    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 
600 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2079  aspartyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 
592 aa  636    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.725699  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  54 
 
 
599 aa  657    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  55.59 
 
 
594 aa  666    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 
594 aa  649    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  65.92 
 
 
591 aa  820    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 
599 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1222  aspartyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 
590 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241157  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 
592 aa  639    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 
585 aa  726    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2035  aspartyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 
598 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 
600 aa  645    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  54.44 
 
 
591 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
600 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 
600 aa  637    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1326  aspartyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 
604 aa  640    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
600 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  56.16 
 
 
598 aa  697    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1106  aspartyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 
590 aa  658    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 
597 aa  690    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 
597 aa  691    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1223  aspartyl-tRNA synthetase  51.96 
 
 
585 aa  638    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106178  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 
593 aa  685    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2115  aspartyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 
590 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789525 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 
600 aa  638    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 
592 aa  644    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1959  aspartyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 
590 aa  656    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9398  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 
586 aa  702    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 
600 aa  638    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 
598 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2226  aspartyl-tRNA synthetase  55.41 
 
 
590 aa  646    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0590  aspartyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 
591 aa  664    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0860  aspartyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 
617 aa  661    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1309  aspartyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 
591 aa  638    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  56.07 
 
 
583 aa  674    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2781  aspartyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 
593 aa  635    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.332179  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 
600 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 
613 aa  669    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1320  aspartyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 
590 aa  658    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2096  aspartyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 
590 aa  658    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.356263  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2055  aspartyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 
590 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  54.41 
 
 
590 aa  642    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 
599 aa  652    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 
594 aa  674    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
600 aa  647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 
600 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 
617 aa  649    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1346  aspartyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 
590 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0494228  hitchhiker  0.00190768 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  58.83 
 
 
600 aa  716    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  66.21 
 
 
591 aa  832    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  55.9 
 
 
610 aa  677    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 
597 aa  676    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
596 aa  652    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>