More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1654 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1128  DNA primase  68.85 
 
 
598 aa  868    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  100 
 
 
605 aa  1247    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  100 
 
 
605 aa  1247    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  37.66 
 
 
601 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  35.62 
 
 
598 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  35.62 
 
 
598 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  35.62 
 
 
598 aa  389  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  35.45 
 
 
598 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  35.62 
 
 
598 aa  389  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  35.28 
 
 
598 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  35.28 
 
 
598 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  35.62 
 
 
598 aa  389  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  36.33 
 
 
571 aa  382  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  35.44 
 
 
600 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.79 
 
 
598 aa  379  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  36.32 
 
 
598 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  33.66 
 
 
621 aa  355  1e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1449  DNA primase  35.02 
 
 
603 aa  310  5e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  32.18 
 
 
626 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  38.08 
 
 
599 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  30.53 
 
 
595 aa  299  8e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  38.39 
 
 
602 aa  298  2e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  37.26 
 
 
655 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  30.54 
 
 
604 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  37 
 
 
660 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  37.22 
 
 
660 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  36.78 
 
 
660 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  37 
 
 
660 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  36.88 
 
 
663 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  34.99 
 
 
613 aa  291  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  40.16 
 
 
664 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  32.14 
 
 
606 aa  290  6e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  35.67 
 
 
663 aa  290  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  35.74 
 
 
652 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  35.32 
 
 
651 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  38.26 
 
 
619 aa  289  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  39.05 
 
 
593 aa  289  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  34.02 
 
 
588 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  34.26 
 
 
601 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  35.86 
 
 
600 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  36.36 
 
 
588 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  35.71 
 
 
662 aa  283  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  35.56 
 
 
640 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  34.98 
 
 
638 aa  283  8.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  30.51 
 
 
637 aa  282  1e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  39.78 
 
 
605 aa  281  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  33.48 
 
 
653 aa  280  5e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  36 
 
 
636 aa  280  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  35.43 
 
 
660 aa  279  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  39.22 
 
 
640 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  36.07 
 
 
599 aa  276  9e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  36.54 
 
 
584 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  34.74 
 
 
599 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  29.38 
 
 
601 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  31.25 
 
 
596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  34.77 
 
 
703 aa  274  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  36.07 
 
 
578 aa  273  7e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  35.39 
 
 
604 aa  273  7e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  37.88 
 
 
614 aa  272  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  40.47 
 
 
564 aa  271  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  38.69 
 
 
656 aa  270  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  40.39 
 
 
694 aa  270  5e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  34.1 
 
 
674 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  38.5 
 
 
613 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  36.31 
 
 
583 aa  270  8e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  36.91 
 
 
587 aa  270  8e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  39.47 
 
 
592 aa  269  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  32.23 
 
 
595 aa  269  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  35.56 
 
 
636 aa  269  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  35.77 
 
 
582 aa  268  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  32.79 
 
 
673 aa  268  2.9999999999999995e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  38.38 
 
 
675 aa  266  5.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  38.86 
 
 
651 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  37.87 
 
 
652 aa  266  8.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  30.82 
 
 
617 aa  264  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  37.46 
 
 
605 aa  265  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  30.99 
 
 
595 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  39.04 
 
 
646 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  39.04 
 
 
646 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  30.5 
 
 
656 aa  263  4.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  33.26 
 
 
704 aa  263  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  34.27 
 
 
544 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  37.67 
 
 
587 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  34.61 
 
 
632 aa  262  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  35.16 
 
 
577 aa  261  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  34.67 
 
 
604 aa  259  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  36.22 
 
 
660 aa  259  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  36.52 
 
 
611 aa  258  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  37.99 
 
 
553 aa  258  3e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  38.97 
 
 
550 aa  257  4e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  37.99 
 
 
572 aa  257  4e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1824  DNA primase  38.86 
 
 
690 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.982037  normal  0.672025 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  33.57 
 
 
657 aa  256  6e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  35.9 
 
 
666 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  35.41 
 
 
676 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  32.1 
 
 
632 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl269  DNA primase  30.76 
 
 
626 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000470008  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  30.65 
 
 
686 aa  254  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  37.19 
 
 
586 aa  254  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  38.32 
 
 
684 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>