82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1523 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1494  ribonuclease HI-like protein  100 
 
 
133 aa  276  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1523  cell wall enzyme EbsB-like protein  100 
 
 
133 aa  276  5e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1010  cell wall enzyme EbsB, putative  74.22 
 
 
131 aa  204  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  39.2 
 
 
128 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  39.2 
 
 
128 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  38.4 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  38.4 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  38.4 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  38.4 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  38.4 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  38.4 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  38.4 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  38.4 
 
 
128 aa  94.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  36 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  27.78 
 
 
369 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  34.35 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  29.6 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0926  RNase HI  31.82 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  27.34 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  28.57 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  27.05 
 
 
313 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  30.08 
 
 
216 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  27.87 
 
 
168 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  26.98 
 
 
383 aa  61.6  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  27.87 
 
 
253 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  27.87 
 
 
253 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  28 
 
 
133 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 
391 aa  60.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 
370 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  26.98 
 
 
365 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  26.98 
 
 
365 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  33.08 
 
 
194 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  26.98 
 
 
365 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1375  RNase HI  29.37 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.65904  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  29.82 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  30.63 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  27.78 
 
 
356 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  25.76 
 
 
382 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  28 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.23 
 
 
364 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  28.91 
 
 
452 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  27.13 
 
 
154 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  23.26 
 
 
211 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  27.2 
 
 
197 aa  51.2  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  30.23 
 
 
198 aa  50.4  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  24.79 
 
 
378 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  25.4 
 
 
197 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  30 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  22.05 
 
 
322 aa  47.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4830  ribonuclease H  29.92 
 
 
145 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935261  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1923  hypothetical protein  27.03 
 
 
124 aa  47  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  26.6 
 
 
199 aa  47  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  25.86 
 
 
412 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  22.95 
 
 
366 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  22.05 
 
 
363 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1717  hypothetical protein  30.71 
 
 
219 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  34.67 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  24.41 
 
 
401 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1768  hypothetical protein  30.71 
 
 
219 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1514  hypothetical protein  31.25 
 
 
219 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1472  hypothetical protein  30.71 
 
 
219 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0667267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1482  hypothetical protein  29.92 
 
 
219 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00299732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1694  hypothetical protein  29.92 
 
 
219 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1510  hypothetical protein  29.92 
 
 
219 aa  43.5  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00387825  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1626  hypothetical protein  29.92 
 
 
219 aa  43.5  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1324  hypothetical protein  32.03 
 
 
219 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000515383  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  25.2 
 
 
440 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  20.66 
 
 
378 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1663  hypothetical protein  30.47 
 
 
219 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1584  RNase HI  33.75 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590507  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  27.47 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0891  ribonuclease H  31.54 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000481849  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  32.89 
 
 
192 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3682  hypothetical protein  30.47 
 
 
219 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  25.2 
 
 
198 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  27.47 
 
 
159 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  20.47 
 
 
378 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  26.98 
 
 
197 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1351  ribonuclease H  25 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  25.93 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  27.47 
 
 
187 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  26.92 
 
 
241 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>