More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1492 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  100 
 
 
66 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192979  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1463  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 
66 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302037  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0972  CSD family cold shock protein  96.97 
 
 
77 aa  130  9e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  84.38 
 
 
67 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  84.38 
 
 
67 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  82.81 
 
 
65 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  82.81 
 
 
67 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  82.81 
 
 
67 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  82.81 
 
 
67 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  82.81 
 
 
67 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  82.81 
 
 
67 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  82.81 
 
 
65 aa  107  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  80.3 
 
 
66 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  82.81 
 
 
65 aa  107  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  80.3 
 
 
66 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  82.81 
 
 
65 aa  107  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0466  CSD family cold shock protein  78.79 
 
 
66 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  80 
 
 
66 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3679  cold shock protein CspB  78.12 
 
 
65 aa  104  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.844549  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1666  cold shock protein CspB  78.12 
 
 
65 aa  104  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1327  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  78.12 
 
 
65 aa  104  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00843058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  76.92 
 
 
66 aa  104  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  76.92 
 
 
66 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  76.92 
 
 
66 aa  104  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  76.92 
 
 
66 aa  104  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  76.92 
 
 
66 aa  104  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  76.92 
 
 
66 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  76.92 
 
 
66 aa  104  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  76.92 
 
 
66 aa  104  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1517  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.56 
 
 
65 aa  103  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0644  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.76 
 
 
66 aa  103  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 
66 aa  103  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1720  cold shock protein CspB  76.56 
 
 
65 aa  103  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1474  cold shock protein  76.56 
 
 
65 aa  103  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1771  cold shock protein CspB  76.56 
 
 
65 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.674817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1587  cold-shock DNA-binding protein family  72.73 
 
 
66 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000012511  unclonable  7.72165e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1054  cold shock protein CspA  79.37 
 
 
67 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  76.56 
 
 
65 aa  102  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1029  cold shock protein  79.37 
 
 
67 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00447e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  76.56 
 
 
65 aa  102  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  76.92 
 
 
66 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1135  cold shock protein CspA  79.37 
 
 
67 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  76.56 
 
 
65 aa  102  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2454  cold shock protein CspA  79.37 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.56 
 
 
65 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2440  cold shock protein CspA  79.37 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11145 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2257  cold shock protein CspA  79.37 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000681816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2216  cold shock protein  79.37 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.62754e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1032  cold shock protein  77.78 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000608124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2177  cold shock protein  79.37 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1035  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.78 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000461706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2521  cold shock protein CspA  79.37 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000175758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2422  cold shock protein CspA  79.37 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  72.73 
 
 
66 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1185  cold shock protein CspA  77.78 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1289  cold shock protein CspA  77.78 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110281  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1584  cold-shock DNA-binding protein family  76.12 
 
 
67 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000297873  unclonable  9.08249e-24 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  72.73 
 
 
66 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4154  cold shock protein CspA  77.78 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857883  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1232  cold shock protein CspA  77.78 
 
 
67 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000325579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1213  cold shock protein CspA  79.37 
 
 
67 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 
66 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  75 
 
 
65 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1697  cold shock protein CspB  75 
 
 
65 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2223  cold-shock DNA-binding protein family  71.88 
 
 
65 aa  100  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000339527  decreased coverage  1.60158e-22 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.73 
 
 
66 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 
66 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.92 
 
 
66 aa  99.4  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2901  cold-shock DNA-binding domain protein  76.19 
 
 
66 aa  99  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000581473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0782  cold-shock DNA-binding domain protein  74.6 
 
 
66 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2387  cold shock protein CspA  77.78 
 
 
67 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2944  cold shock protein CspA  77.78 
 
 
67 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000190383  hitchhiker  0.00000000328218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05400  putative cold-shock DNA-binding domain protein  73.02 
 
 
67 aa  98.2  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.33246e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1817  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 
66 aa  98.2  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2178  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 
65 aa  97.8  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1777  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.19 
 
 
67 aa  97.4  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 
66 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0803  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 
66 aa  97.1  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05490  putative cold-shock DNA-binding domain protein  74.6 
 
 
68 aa  96.7  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.94484e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1369  hypothetical protein  75.38 
 
 
66 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309276 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2236  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.6 
 
 
67 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000182228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  72.31 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  72.31 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  72.31 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  72.31 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  72.31 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  72.31 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0310  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 
67 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  72.31 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.31 
 
 
65 aa  95.5  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.25 
 
 
66 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  72.31 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 
67 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  72.31 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8123  cold-shock DNA-binding domain protein  69.84 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0555  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
66 aa  95.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000705321  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4469  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.88 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  73.02 
 
 
83 aa  95.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8911  putative cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 
66 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>