158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1412 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  100 
 
 
190 aa  391  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  100 
 
 
190 aa  391  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  69.1 
 
 
178 aa  256  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  41.42 
 
 
258 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  40.27 
 
 
175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  36.9 
 
 
372 aa  110  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  41.84 
 
 
237 aa  109  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  38.82 
 
 
276 aa  108  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  39.71 
 
 
350 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  37.93 
 
 
351 aa  106  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  45.38 
 
 
324 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  38.41 
 
 
327 aa  105  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  41.67 
 
 
323 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  40.94 
 
 
408 aa  104  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  33.13 
 
 
271 aa  104  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  38.52 
 
 
346 aa  98.2  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  38.46 
 
 
183 aa  97.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  35.71 
 
 
228 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  35.71 
 
 
228 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  37.76 
 
 
183 aa  94.4  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  36.11 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  42.99 
 
 
382 aa  92  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  38.81 
 
 
200 aa  91.7  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  37.78 
 
 
374 aa  92  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  36.23 
 
 
180 aa  90.9  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  39.84 
 
 
266 aa  89.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  38.58 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  37.59 
 
 
218 aa  90.1  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  38.58 
 
 
284 aa  88.2  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  35.62 
 
 
209 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  40.16 
 
 
214 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  35.86 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  39.53 
 
 
231 aa  85.1  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  38.58 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  38.58 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  35.77 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  30.56 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  34.25 
 
 
282 aa  78.2  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  36.3 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  32.58 
 
 
266 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  37.04 
 
 
249 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  31.76 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  34.4 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  33.83 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  34.56 
 
 
273 aa  74.7  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  33.83 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  31.02 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  35.46 
 
 
260 aa  72  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  34.92 
 
 
171 aa  72  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  39.84 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 
278 aa  71.6  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  34.62 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2850  nuclease (SNase domain protein)  30.2 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  33.1 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1570  nuclease family protein  38.68 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.30531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0076  hypothetical protein  26.35 
 
 
251 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  33.33 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  33.08 
 
 
247 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2995  nuclease (SNase domain protein)  32.8 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  32.82 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  31.3 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  26.92 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  33.33 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  30.59 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  31.88 
 
 
272 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  36.72 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  32.81 
 
 
169 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  26.52 
 
 
256 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  33.33 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  33.59 
 
 
185 aa  61.2  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  26.06 
 
 
171 aa  60.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  32.06 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  29.37 
 
 
263 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  33.6 
 
 
175 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  30.88 
 
 
247 aa  59.7  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  32.8 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  26.11 
 
 
273 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  28.03 
 
 
255 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  26.23 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 
161 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  26.97 
 
 
184 aa  58.9  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  23.3 
 
 
192 aa  58.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0124  nuclease (SNase-like)  30.15 
 
 
275 aa  58.5  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00271835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  31.97 
 
 
163 aa  58.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  30.69 
 
 
199 aa  58.2  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  29.46 
 
 
273 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  29.32 
 
 
257 aa  58.2  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  32 
 
 
175 aa  58.2  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  32.58 
 
 
158 aa  58.2  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  27.81 
 
 
272 aa  57.8  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  30.88 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  29.46 
 
 
255 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1665  nuclease (SNase domain protein)  32.89 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.409735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  27.11 
 
 
185 aa  55.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  29.46 
 
 
273 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  30.77 
 
 
388 aa  55.5  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  30.66 
 
 
153 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf871  nuclease, lipoprotein  26.54 
 
 
234 aa  54.7  0.0000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  27.69 
 
 
162 aa  54.3  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  30.08 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>