More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1343 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  100 
 
 
293 aa  589  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  100 
 
 
293 aa  589  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  91.03 
 
 
292 aa  505  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  70 
 
 
295 aa  388  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  70 
 
 
295 aa  388  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  70 
 
 
295 aa  388  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  70 
 
 
295 aa  388  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  70 
 
 
295 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  70 
 
 
295 aa  388  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  70.34 
 
 
295 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  69.66 
 
 
295 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  69.66 
 
 
295 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  69.31 
 
 
295 aa  385  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  68.28 
 
 
295 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  66.55 
 
 
294 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  63.45 
 
 
294 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  55.48 
 
 
291 aa  334  1e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  51.38 
 
 
291 aa  293  2e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0976  elongation factor Ts  49.83 
 
 
292 aa  278  7e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120791  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  51.19 
 
 
292 aa  276  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  50 
 
 
294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  51.18 
 
 
310 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  50.17 
 
 
291 aa  272  6e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  50.69 
 
 
289 aa  271  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  50.17 
 
 
305 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  50.17 
 
 
305 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  48.99 
 
 
307 aa  268  7e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  48.99 
 
 
307 aa  266  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  48.32 
 
 
307 aa  266  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  48.21 
 
 
310 aa  265  8e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  49.49 
 
 
292 aa  262  4.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  50.34 
 
 
291 aa  261  8e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  51.54 
 
 
299 aa  261  8e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  46.6 
 
 
308 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  47.24 
 
 
290 aa  259  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  47.25 
 
 
308 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  47.73 
 
 
312 aa  258  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  49.49 
 
 
293 aa  258  7e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  47.44 
 
 
313 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  47.8 
 
 
289 aa  257  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  46.93 
 
 
308 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  47.6 
 
 
296 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  50.53 
 
 
290 aa  256  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  45.08 
 
 
292 aa  254  9e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0372  elongation factor Ts  45.24 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  47.95 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  44.75 
 
 
292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  48.81 
 
 
293 aa  251  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  48.28 
 
 
291 aa  249  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  49.48 
 
 
294 aa  249  4e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  47.22 
 
 
283 aa  246  4e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  45.45 
 
 
301 aa  245  6e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  46.58 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  42.86 
 
 
311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  46.64 
 
 
294 aa  243  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  47.46 
 
 
302 aa  242  6e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  45.76 
 
 
285 aa  242  7e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  49.83 
 
 
303 aa  242  7e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  49.83 
 
 
303 aa  241  9e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl560  elongation factor Ts  44.03 
 
 
297 aa  241  1e-62  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  46.21 
 
 
292 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  46.13 
 
 
292 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  45.76 
 
 
285 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  44.9 
 
 
314 aa  240  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  46.13 
 
 
292 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  45.55 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0802  elongation factor Ts  44.15 
 
 
341 aa  238  6.999999999999999e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000434061  hitchhiker  0.00000000000000232724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  45.34 
 
 
309 aa  238  9e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  44.92 
 
 
308 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  45.7 
 
 
303 aa  236  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  45.77 
 
 
292 aa  236  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1102  elongation factor Ts  44.78 
 
 
287 aa  235  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  47.4 
 
 
287 aa  234  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  43.62 
 
 
292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  43.93 
 
 
308 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  44.75 
 
 
285 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  44.75 
 
 
285 aa  232  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  44.75 
 
 
285 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  47.62 
 
 
291 aa  232  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  46.9 
 
 
292 aa  232  6e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0106  elongation factor Ts  43.7 
 
 
346 aa  231  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  43.69 
 
 
283 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  43.69 
 
 
283 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  43.69 
 
 
283 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  43.69 
 
 
283 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  43.69 
 
 
283 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  43.69 
 
 
283 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  43.69 
 
 
283 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  45.39 
 
 
301 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  43.69 
 
 
283 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  43.69 
 
 
283 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1831  elongation factor Ts  44.14 
 
 
346 aa  230  3e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0135802  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38980  elongation factor Ts  46.39 
 
 
289 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  44.59 
 
 
287 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  44.78 
 
 
300 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  48 
 
 
308 aa  228  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  43.69 
 
 
283 aa  229  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  43.96 
 
 
296 aa  228  8e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  44.52 
 
 
287 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  43.96 
 
 
296 aa  228  8e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>