More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1281 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1281  RluA family pseudouridine synthase  100 
 
 
305 aa  626  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.71357  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1256  RluA family pseudouridine synthase  100 
 
 
305 aa  626  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0763  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  84.92 
 
 
305 aa  542  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3937  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  67.12 
 
 
302 aa  411  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000762664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3743  RNA pseudouridylate synthase  67.12 
 
 
302 aa  411  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00315275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3651  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  67.47 
 
 
302 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169242  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3906  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  67.12 
 
 
302 aa  411  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000340417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3719  RluA family pseudouridine synthase  67.12 
 
 
302 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00132143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3944  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  67.12 
 
 
302 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3634  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  66.78 
 
 
302 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0043574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4031  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  66.78 
 
 
302 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00039208  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3993  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  67.7 
 
 
302 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000288046  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2541  RluA family pseudouridine synthase  67.48 
 
 
302 aa  407  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.15335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1911  pseudouridine synthase, RluA family  64.59 
 
 
304 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1248  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  67.13 
 
 
302 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000362529  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1041  pseudouridine synthase, RluA family  64.26 
 
 
304 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000866742  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  60.4 
 
 
303 aa  347  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1673  RluA family pseudouridine synthase  56.11 
 
 
306 aa  332  5e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.529944  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  58.36 
 
 
296 aa  329  3e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1365  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  58.08 
 
 
296 aa  328  8e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00766831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  57.14 
 
 
305 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  55.22 
 
 
301 aa  315  5e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  53.72 
 
 
305 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  54.61 
 
 
303 aa  307  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1014  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  54.33 
 
 
304 aa  306  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000716198  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4022  pseudouridine synthase, RluA family  55.23 
 
 
334 aa  306  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000767359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0869  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  50 
 
 
306 aa  298  6e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  53.77 
 
 
306 aa  297  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  53.77 
 
 
306 aa  297  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1286  pseudouridylate synthase  48.03 
 
 
305 aa  295  5e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00677773  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  50 
 
 
331 aa  293  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1813  pseudouridine synthase, RluA family  49.65 
 
 
303 aa  291  7e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1079  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  52.94 
 
 
304 aa  290  2e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2356  RluA family pseudouridine synthase  48.55 
 
 
313 aa  285  9e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  48.47 
 
 
310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  47.35 
 
 
309 aa  280  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  49.14 
 
 
308 aa  276  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1373  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  53.02 
 
 
312 aa  276  4e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  50.83 
 
 
304 aa  275  5e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  48.32 
 
 
305 aa  270  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  48.01 
 
 
306 aa  263  4e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  48.11 
 
 
300 aa  261  8e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0553  pseudouridine synthase, RluA family  46.42 
 
 
352 aa  260  2e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1303  pseudouridine synthase, RluA family  47.16 
 
 
314 aa  259  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2924  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  43.67 
 
 
312 aa  258  8e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459608  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  45.55 
 
 
313 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1219  pseudouridine synthase, RluA family  46.71 
 
 
342 aa  255  5e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08006  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  45.99 
 
 
356 aa  255  7e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2950  suppressor of ftsH mutation  43.37 
 
 
326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1572  RluA family pseudouridine synthase  44.62 
 
 
420 aa  252  6e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00305296  hitchhiker  0.00710721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2620  RluA family pseudouridine synthase  45.96 
 
 
347 aa  252  7e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  45.3 
 
 
311 aa  251  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0749  pseudouridine synthase, RluA family  45.78 
 
 
318 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0778  pseudouridine synthase, RluA family  46.28 
 
 
318 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  45.3 
 
 
311 aa  249  5e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2903  RluA family pseudouridine synthase  45.27 
 
 
323 aa  248  7e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413037  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3490  pseudouridine synthase, RluA family  42.14 
 
 
329 aa  247  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.788611  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2578  pseudouridine synthase, RluA family  44.73 
 
 
343 aa  247  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.728308  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1515  pseudouridine synthase, RluA family  43.48 
 
 
306 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0647442 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2552  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  42.53 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0920144  normal  0.0397584 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0878  RluA family pseudouridine synthase  43.04 
 
 
325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.175115  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2034  pseudouridine synthase, RluA family  43.09 
 
 
319 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0482  pseudouridine synthase, RluA family  43.44 
 
 
326 aa  241  9e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.147798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  44.34 
 
 
322 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02221  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  45.21 
 
 
320 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.135305  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1102  RluA family pseudouridine synthase  45.48 
 
 
314 aa  240  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1390  pseudouridine synthase, RluA family  42.64 
 
 
348 aa  239  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.568078 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  43.81 
 
 
318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28001  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  43.05 
 
 
324 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0810  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  44.04 
 
 
318 aa  239  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.043607  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0254  RluA family pseudouridine synthase  42.95 
 
 
316 aa  238  5.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128568  normal  0.0139126 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1612  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  42.72 
 
 
356 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000933226 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0395  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  43 
 
 
322 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.134097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3146  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  43.43 
 
 
343 aa  238  9e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19664  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1651  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  44.68 
 
 
347 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1911  pseudouridine synthase, RluA family  43.75 
 
 
356 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.743404  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1598  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  44.68 
 
 
334 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60210  pseudouridine synthase  42.76 
 
 
320 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135219 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3127  pseudouridine synthase, RluA family  43.61 
 
 
327 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl387  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase  47.22 
 
 
311 aa  236  4e-61  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.319286  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1324  pseudouridine synthase, RluA family  41.99 
 
 
328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4547  RluA family pseudouridine synthase  40.33 
 
 
352 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1742  pseudouridine synthase, RluD  43.85 
 
 
376 aa  235  7e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0441246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1849  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  42.39 
 
 
316 aa  235  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.97184  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2235  RluA family pseudouridine synthase  42.86 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.894524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0061  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.42 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102185  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1237  RluA family pseudouridine synthase  44.51 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289539  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1985  RluA family pseudouridine synthase  41.59 
 
 
377 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.122684  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1100  pseudouridine synthase, RluA family  46.01 
 
 
297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0606  pseudouridine synthase RluD  42.59 
 
 
391 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.32929  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3196  RluA family pseudouridine synthase  42.09 
 
 
315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1287  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D (pseudouridylate synthase) (Uracil hydrolyase)  43.09 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1111  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  43.4 
 
 
343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.522532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5183  pseudouridine synthase  42.11 
 
 
320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.521194  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0881  RluA family pseudouridine synthase  43.92 
 
 
320 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000267472  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1112  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  42.57 
 
 
313 aa  231  9e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0997976  normal  0.952064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1628  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D protein  42.62 
 
 
358 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02111  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  42.96 
 
 
319 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2613  RluA family pseudouridine synthase  42.64 
 
 
343 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0669  RluA family pseudouridine synthase  40 
 
 
352 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>