More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1272 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1247  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 
222 aa  455  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000447038  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1272  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 
222 aa  455  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000279227  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0753  hypothetical protein  74.55 
 
 
222 aa  347  1e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.174095  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  56.31 
 
 
226 aa  265  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  55.91 
 
 
224 aa  254  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  55.91 
 
 
224 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  55.91 
 
 
224 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  55 
 
 
224 aa  250  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  61.14 
 
 
224 aa  249  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  61.14 
 
 
224 aa  248  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  61.14 
 
 
224 aa  248  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  61.14 
 
 
224 aa  248  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  61.14 
 
 
224 aa  248  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  61.14 
 
 
224 aa  248  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  61.14 
 
 
224 aa  248  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  55.45 
 
 
224 aa  245  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2061  TIM-barrel fold family protein  49.32 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  52.71 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0480  ylmE protein, putative  48.17 
 
 
224 aa  201  6e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  44.16 
 
 
225 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  39.04 
 
 
244 aa  164  9e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  44.39 
 
 
226 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  41.92 
 
 
202 aa  158  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  38.94 
 
 
240 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  42.64 
 
 
231 aa  155  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  42.93 
 
 
228 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  38.5 
 
 
225 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  38.43 
 
 
235 aa  148  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  40.7 
 
 
230 aa  148  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  38.84 
 
 
234 aa  148  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  37.5 
 
 
219 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  40.2 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  37.5 
 
 
233 aa  144  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  38.07 
 
 
236 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09518  hypothetical protein  41.21 
 
 
219 aa  142  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  36.56 
 
 
227 aa  142  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  41.41 
 
 
224 aa  141  9e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  36.44 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  36.44 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  36.04 
 
 
233 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  36.94 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  37.88 
 
 
233 aa  138  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  38.39 
 
 
220 aa  138  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2661  hypothetical protein  39.02 
 
 
220 aa  138  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  35.11 
 
 
261 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  39.7 
 
 
213 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  37.44 
 
 
235 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  36.32 
 
 
228 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  37.5 
 
 
234 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  36.41 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  39.59 
 
 
231 aa  135  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  37.07 
 
 
230 aa  134  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  39.19 
 
 
244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3319  alanine racemase domain protein  41.31 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000402103  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  38.61 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  38.74 
 
 
262 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  39.02 
 
 
235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2126  hypothetical protein  38.69 
 
 
224 aa  132  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  35.56 
 
 
230 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  39.59 
 
 
228 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  40.2 
 
 
227 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  40.7 
 
 
223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  36.06 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  38.69 
 
 
280 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  33.78 
 
 
261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  38.58 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  36.68 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  37.5 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  36.5 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  36.56 
 
 
227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  40.2 
 
 
229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  37.02 
 
 
224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  33.79 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6290  alanine racemase domain protein  39.25 
 
 
225 aa  128  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418922  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  36.84 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  38.38 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  38.19 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  35.71 
 
 
276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  36.36 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  38 
 
 
235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  36.16 
 
 
228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  34.4 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  36.77 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  35.71 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  35.14 
 
 
219 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 
257 aa  125  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  34.65 
 
 
235 aa  125  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  38.19 
 
 
229 aa  124  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  38.07 
 
 
275 aa  124  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  36 
 
 
229 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2190  hypothetical cytosolic protein  32.31 
 
 
228 aa  123  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.724398  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2216  hypothetical protein  32.31 
 
 
228 aa  123  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000309161  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  35.87 
 
 
229 aa  123  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  36.18 
 
 
235 aa  123  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  34.22 
 
 
231 aa  123  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  38.89 
 
 
241 aa  122  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  34.85 
 
 
237 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  38.19 
 
 
229 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  35.35 
 
 
241 aa  122  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  35.68 
 
 
230 aa  122  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>