More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1178 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
468 aa  939    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  95.73 
 
 
468 aa  908    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.88 
 
 
470 aa  695    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.88 
 
 
470 aa  696    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.88 
 
 
470 aa  696    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.88 
 
 
470 aa  696    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.88 
 
 
470 aa  696    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.88 
 
 
470 aa  695    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.44 
 
 
470 aa  704    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.66 
 
 
470 aa  693    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.88 
 
 
470 aa  696    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.38 
 
 
470 aa  709    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.88 
 
 
470 aa  696    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.88 
 
 
470 aa  695    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
468 aa  939    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.29 
 
 
470 aa  716    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.8 
 
 
459 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.77 
 
 
470 aa  567  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.82 
 
 
473 aa  512  1e-144  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0634  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.3 
 
 
475 aa  506  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000338686  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0048  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.3 
 
 
472 aa  496  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0740  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.49 
 
 
469 aa  492  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010396  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.62 
 
 
492 aa  419  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.3 
 
 
616 aa  415  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.03 
 
 
491 aa  414  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.28 
 
 
481 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.53 
 
 
465 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.31 
 
 
475 aa  395  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.77 
 
 
465 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.38 
 
 
467 aa  388  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.04 
 
 
484 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.47 
 
 
484 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.82 
 
 
484 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.41 
 
 
475 aa  382  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.61 
 
 
593 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2991  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.46 
 
 
464 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.81 
 
 
474 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3554  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.94 
 
 
464 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.23 
 
 
607 aa  375  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.15 
 
 
465 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.44 
 
 
602 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35490  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.03 
 
 
464 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730291 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.26 
 
 
603 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.28 
 
 
476 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.28 
 
 
476 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0421  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.81 
 
 
475 aa  375  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000187748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.28 
 
 
476 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.06 
 
 
476 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3429  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.93 
 
 
475 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0358795  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.41 
 
 
476 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.41 
 
 
476 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.06 
 
 
476 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.06 
 
 
476 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0321  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.15 
 
 
476 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0683294 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.06 
 
 
476 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2076  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.79 
 
 
588 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.83 
 
 
603 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.06 
 
 
476 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0433  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.49 
 
 
475 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.2 
 
 
476 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0527  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.86 
 
 
464 aa  368  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2589  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.14 
 
 
600 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  decreased coverage  0.000383256 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
476 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.2 
 
 
476 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.58 
 
 
463 aa  366  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
476 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
476 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3775  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.49 
 
 
476 aa  368  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.2 
 
 
476 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
476 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0459  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.64 
 
 
464 aa  365  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.37 
 
 
625 aa  365  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3854  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.84 
 
 
475 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.075768  hitchhiker  0.000000345632 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1468  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.57 
 
 
685 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0186247  normal  0.515746 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.99 
 
 
463 aa  364  2e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3911  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.62 
 
 
475 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000450783  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3932  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.62 
 
 
475 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000133391  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
476 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4052  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.62 
 
 
475 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00676379  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3381  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.05 
 
 
476 aa  364  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000696126  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0428  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.84 
 
 
475 aa  364  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00251394  normal  0.166632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3597  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.84 
 
 
475 aa  364  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000546829  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0426  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.84 
 
 
475 aa  363  3e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.33 
 
 
480 aa  363  3e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.4 
 
 
468 aa  363  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.58 
 
 
462 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.14 
 
 
603 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110052  normal  0.0211512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0430  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.62 
 
 
475 aa  363  3e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03223  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.25 
 
 
473 aa  363  4e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.416876  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.97 
 
 
468 aa  363  4e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.58 
 
 
462 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1719  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  43.57 
 
 
589 aa  362  6e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0148218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2228  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  43.57 
 
 
589 aa  362  6e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.467573  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.03 
 
 
462 aa  362  6e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2153  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.96 
 
 
590 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3092  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  43.57 
 
 
589 aa  362  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0122251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1500  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  43.57 
 
 
589 aa  362  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3543  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.49 
 
 
474 aa  362  6e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.399649  normal  0.262226 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2135  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.96 
 
 
588 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0126  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.49 
 
 
495 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>