More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0986 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  36.84 
 
 
1241 aa  743  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  36.2 
 
 
1241 aa  742  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  35.49 
 
 
1242 aa  699  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  36.86 
 
 
1241 aa  743  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  36.54 
 
 
1241 aa  740  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  36.39 
 
 
1241 aa  741  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  36.53 
 
 
1241 aa  742  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  36.22 
 
 
1241 aa  740  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  36.97 
 
 
1240 aa  745  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  36.4 
 
 
1242 aa  737  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  100 
 
 
1217 aa  2497  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  100 
 
 
1217 aa  2497  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  33.46 
 
 
1251 aa  639  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  36.66 
 
 
1244 aa  727  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  33.59 
 
 
1271 aa  636  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  36.94 
 
 
1241 aa  748  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  75.64 
 
 
1218 aa  1915  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  36.94 
 
 
1241 aa  748  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  33.57 
 
 
1270 aa  635  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  33.18 
 
 
1248 aa  608  1e-172  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  33.86 
 
 
1233 aa  593  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  31.86 
 
 
1230 aa  592  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  30.87 
 
 
1244 aa  569  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  31.25 
 
 
1236 aa  567  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  30.6 
 
 
1282 aa  554  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  30.13 
 
 
1377 aa  546  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  33.23 
 
 
1392 aa  508  1e-142  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  31.8 
 
 
1204 aa  503  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  31.02 
 
 
1186 aa  498  1e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.15 
 
 
1230 aa  479  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.06 
 
 
1203 aa  476  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0482  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  31.69 
 
 
1405 aa  454  1e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  29.66 
 
 
1207 aa  430  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  30.01 
 
 
1217 aa  429  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  27.95 
 
 
1121 aa  412  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  29.39 
 
 
1392 aa  376  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 
1240 aa  366  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  23.48 
 
 
1057 aa  189  4e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  24.23 
 
 
1184 aa  160  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.11 
 
 
1139 aa  159  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  27.96 
 
 
1080 aa  159  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  26.12 
 
 
1123 aa  150  2e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0699  UvrD/REP helicase  25.39 
 
 
1052 aa  147  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  23.62 
 
 
1173 aa  144  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1986  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.19 
 
 
1209 aa  142  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259297  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  25.04 
 
 
1147 aa  141  9e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  22.62 
 
 
1124 aa  140  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.17 
 
 
772 aa  139  3e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4844  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.99 
 
 
776 aa  138  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  23.32 
 
 
1161 aa  137  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  25.45 
 
 
1164 aa  137  1e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  26.41 
 
 
1149 aa  137  2e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.28 
 
 
797 aa  135  4e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  24.88 
 
 
638 aa  135  4e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  23.63 
 
 
1226 aa  134  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00770  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  23.62 
 
 
1262 aa  133  2e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  24.77 
 
 
735 aa  133  2e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.23 
 
 
763 aa  132  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  26.02 
 
 
771 aa  133  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.73 
 
 
773 aa  133  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  22.04 
 
 
1185 aa  132  4e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  26.77 
 
 
728 aa  132  5e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0804  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  21.77 
 
 
1242 aa  131  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.888497  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.26 
 
 
828 aa  131  8e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  25.38 
 
 
1185 aa  131  8e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1169  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.95 
 
 
1269 aa  131  1e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  26.39 
 
 
728 aa  131  1e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3023  UvrD/REP helicase  23.95 
 
 
706 aa  129  2e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  23.05 
 
 
1121 aa  130  2e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  25.6 
 
 
1110 aa  130  2e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  24.42 
 
 
678 aa  130  2e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  24.36 
 
 
1115 aa  129  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  24.36 
 
 
739 aa  129  4e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  22.35 
 
 
1165 aa  129  4e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  24.91 
 
 
728 aa  129  4e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  27.32 
 
 
1074 aa  129  5e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.87 
 
 
785 aa  128  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  25.24 
 
 
729 aa  128  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  26.99 
 
 
727 aa  128  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.03 
 
 
732 aa  128  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  24.54 
 
 
1107 aa  128  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.87 
 
 
785 aa  128  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.26 
 
 
785 aa  128  8e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  24.95 
 
 
678 aa  127  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.86 
 
 
858 aa  127  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08490  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  26.16 
 
 
1251 aa  126  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  25 
 
 
794 aa  126  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  24.95 
 
 
727 aa  126  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.28 
 
 
713 aa  126  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.84 
 
 
725 aa  126  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5401  DNA-dependent helicase II  25.05 
 
 
728 aa  125  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0541595 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.37 
 
 
1207 aa  125  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  25.04 
 
 
1117 aa  125  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5352  DNA-dependent helicase II  25.05 
 
 
728 aa  125  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138491 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  24.72 
 
 
723 aa  125  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.6 
 
 
784 aa  124  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5260  DNA-dependent helicase II  24.86 
 
 
728 aa  124  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.658271 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  24.72 
 
 
723 aa  124  9e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1101  UvrD/REP helicase  23.62 
 
 
1065 aa  124  9e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  25.47 
 
 
1047 aa  124  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>