More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0948 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0948  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  100 
 
 
319 aa  664  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  100 
 
 
319 aa  664  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0516  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  61.64 
 
 
323 aa  428  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  50.63 
 
 
327 aa  336  3e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  49.68 
 
 
324 aa  326  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  46.08 
 
 
327 aa  284  2e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  41.64 
 
 
334 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.66306e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  45.11 
 
 
319 aa  277  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  41.67 
 
 
341 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  41.36 
 
 
340 aa  269  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4738  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.38 
 
 
335 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.97 
 
 
323 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21840  glycerate dehydrogenase  47.58 
 
 
274 aa  259  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0628061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1980  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.21 
 
 
337 aa  256  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00177006  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  41.8 
 
 
322 aa  254  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1344  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.4 
 
 
338 aa  254  1e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  9.16966e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2722  Glyoxylate reductase  41.85 
 
 
322 aa  254  1e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  41.48 
 
 
322 aa  254  1e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2536  Glyoxylate reductase  40.13 
 
 
318 aa  254  2e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.400778  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2855  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  47.99 
 
 
345 aa  253  2e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3305  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.06 
 
 
326 aa  254  2e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106249  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  40.44 
 
 
339 aa  253  2e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01261  glyoxylate reductase  42.09 
 
 
357 aa  253  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1055  putative 2-ketogluconate reductase  43.21 
 
 
329 aa  252  5e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453288  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0811  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.69 
 
 
329 aa  252  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868894  normal  0.495014 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0256  glyoxylate reductase  38.73 
 
 
315 aa  251  9e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1511  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  47.08 
 
 
330 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2809  glyoxylate reductase  42.99 
 
 
348 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00726035  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0052  Glyoxylate reductase  43.57 
 
 
316 aa  251  1e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1700  glyoxylate reductase  43.08 
 
 
329 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0142261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2150  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.17 
 
 
328 aa  249  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2490  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.15 
 
 
326 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.0359578 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1370  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.15 
 
 
326 aa  249  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  41.4 
 
 
317 aa  248  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2784  glyoxylate reductase  42.46 
 
 
352 aa  245  7e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0203307  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2144  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.41 
 
 
327 aa  245  8e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2498  glyoxylate reductase  42.46 
 
 
346 aa  245  9e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175353  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1774  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.81 
 
 
328 aa  245  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1821  glyoxylate reductase  42.46 
 
 
346 aa  245  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.011783  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0513  2-hydroxyacid dehydrogenase  42.46 
 
 
329 aa  244  1e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3874  2-ketogluconate reductase  43.08 
 
 
324 aa  244  1e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.28 
 
 
329 aa  244  1e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501657  normal  0.548764 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2870  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  42.15 
 
 
352 aa  244  1e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156686  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05388  2-hydroxyacid dehydrogenase  46.21 
 
 
331 aa  244  2e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2926  2-hydroxyacid dehydrogenase  42.15 
 
 
329 aa  244  2e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00357192  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.95 
 
 
323 aa  244  2e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.77 
 
 
324 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3754  2-ketogluconate reductase  42.77 
 
 
324 aa  243  4e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03403  2-ketoaldonate reductase/glyoxylate reductase B  42.77 
 
 
324 aa  242  5e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3973  2-ketogluconate reductase  42.77 
 
 
324 aa  242  5e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03354  hypothetical protein  42.77 
 
 
324 aa  242  5e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4929  2-ketogluconate reductase  42.77 
 
 
324 aa  242  5e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1622  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  43.44 
 
 
328 aa  243  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4049  2-ketogluconate reductase  42.77 
 
 
324 aa  242  5e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0159  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding protein  42.45 
 
 
324 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3969  2-ketogluconate reductase  42.01 
 
 
324 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0592  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.69 
 
 
326 aa  240  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.80162  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0089  Glyoxylate reductase  40.25 
 
 
319 aa  240  3e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4029  2-ketogluconate reductase  41.05 
 
 
324 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0243111  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2977  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  40.56 
 
 
328 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269444  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3925  2-ketogluconate reductase  41.05 
 
 
324 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1989  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.86 
 
 
332 aa  239  6e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.14509e-07 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1522  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.87 
 
 
320 aa  239  6e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.417299  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2281  2-hydroxyacid dehydrogenase  46.51 
 
 
331 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.882044  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3860  2-ketogluconate reductase  40.74 
 
 
324 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0892  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.96 
 
 
318 aa  237  2e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0266088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  43.44 
 
 
328 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431872  normal  0.295585 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2029  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.17 
 
 
331 aa  236  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.658247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  39.87 
 
 
322 aa  236  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4216  2-hydroxyacid dehydrogenase  42.46 
 
 
329 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243967  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3841  2-ketogluconate reductase  41.38 
 
 
324 aa  235  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2069  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.33 
 
 
338 aa  235  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  hitchhiker  0.00440451 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1062  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.46 
 
 
329 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  5.58591e-05  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0384  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.56 
 
 
338 aa  234  1e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5047  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  41.85 
 
 
330 aa  234  2e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3514  gluconate 2-dehydrogenase  41.21 
 
 
320 aa  233  2e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1103  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.15 
 
 
329 aa  234  2e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0057  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.59 
 
 
325 aa  234  2e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0624  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.15 
 
 
329 aa  234  2e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627467  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5135  gluconate 2-dehydrogenase  41.85 
 
 
330 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2286  2-ketogluconate reductase  40.88 
 
 
325 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2151  gluconate 2-dehydrogenase  40.88 
 
 
325 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00341832  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4613  gluconate 2-dehydrogenase  41.85 
 
 
330 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1954  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  37.03 
 
 
329 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0249135 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4773  gluconate 2-dehydrogenase  41.85 
 
 
330 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4635  gluconate 2-dehydrogenase  41.85 
 
 
330 aa  233  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2094  gluconate 2-dehydrogenase  40.88 
 
 
325 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35320  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  39.01 
 
 
328 aa  232  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317653  normal  0.274973 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5014  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  41.85 
 
 
330 aa  232  8e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3914  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  36.68 
 
 
327 aa  231  9e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.430325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26910  2-ketogluconate 6-phosphate reductase  44.68 
 
 
329 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0278379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5042  gluconate 2-dehydrogenase  41.53 
 
 
320 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2904  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  46.88 
 
 
322 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0199  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  41.85 
 
 
330 aa  230  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4725  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.85 
 
 
320 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4137  2-ketogluconate reductase  40.88 
 
 
326 aa  229  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3789  2-ketogluconate reductase  40.88 
 
 
326 aa  229  5e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0055  Gluconate 2-dehydrogenase  41.82 
 
 
321 aa  229  6e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0167  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.88 
 
 
324 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2446  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.72 
 
 
334 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>