76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0869 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0853  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
110 aa  229  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0869  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 
110 aa  229  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3076  helix-turn-helix domain protein  33.01 
 
 
116 aa  78.2  4e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3829  hypothetical protein  44.58 
 
 
137 aa  77.4  6e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3545  hypothetical protein  44.58 
 
 
140 aa  77  7e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5811  helix-turn-helix domain-containing protein  37.61 
 
 
141 aa  75.5  2e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2969  helix-turn-helix domain-containing protein  36.04 
 
 
140 aa  69.3  2e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  4.18472e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4801  helix-turn-helix domain protein  45.76 
 
 
261 aa  67  8e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3075  transcriptional regulator, XRE family  32.58 
 
 
105 aa  66.2  1e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0652  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 
115 aa  60.1  1e-08  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  33.64 
 
 
117 aa  56.2  1e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1882  prophage LambdaSa2, repressor protein, putative  48.33 
 
 
120 aa  53.9  6e-07  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2269  XRE family transcriptional regulator  27.97 
 
 
127 aa  53.1  1e-06  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  33.65 
 
 
115 aa  51.2  4e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.42648e-12  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  33.65 
 
 
115 aa  51.2  4e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.52617e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  32.11 
 
 
114 aa  50.8  6e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  32.11 
 
 
114 aa  50.8  6e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  32.43 
 
 
117 aa  49.7  1e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  1.0572e-06  hitchhiker  2.67972e-05 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1099  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 
115 aa  50.1  1e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  27.83 
 
 
115 aa  48.9  2e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 
152 aa  48.5  3e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.19777e-11  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
111 aa  48.5  3e-05  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.60527e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1687  XRE family transcriptional regulator  27.84 
 
 
111 aa  48.9  3e-05  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00137686  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  28.81 
 
 
125 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  40.98 
 
 
436 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 
281 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  7.86405e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1536  XRE family transcriptional regulator  29.69 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1530  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 
321 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 
124 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.03467e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1344  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.043914  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  34.65 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1628  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  29.81 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  34.15 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 
380 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  36.51 
 
 
301 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  28.71 
 
 
327 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 
231 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.92 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  1.42015e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
133 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  28.72 
 
 
133 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 
194 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5487  hypothetical protein  36.51 
 
 
269 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  41.82 
 
 
99 aa  41.6  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2295  transcriptional regulator  36.36 
 
 
106 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.302272  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  39.66 
 
 
200 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.78065e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  25.23 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0023  transcriptional regulator  29.25 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.181624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 
206 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  7.59518e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0755  DNA-binding protein  32.84 
 
 
181 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  32.84 
 
 
181 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  38.98 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  32.84 
 
 
181 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4442  DNA-binding protein  32.84 
 
 
181 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  32.84 
 
 
181 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4493  DNA-binding protein  32.84 
 
 
181 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4094  transcriptional regulator  32.84 
 
 
181 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  32.84 
 
 
181 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4590  DNA-binding protein  32.84 
 
 
181 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6290  transcriptional regulator, XRE family  28.85 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  33.87 
 
 
206 aa  40.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  37.21 
 
 
496 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  37.21 
 
 
496 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  37.21 
 
 
496 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>