More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0706 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0320  AraC family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 724 aa  678    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.804033  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0706  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 716 aa  1440    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0691  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 716 aa  1440    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1972  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 701 aa  110  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000433091  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2452  helix-turn-helix domain-containing protein  21.39 
 
 		 701 aa  88.2  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0494728  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2405  helix-turn-helix domain-containing protein  21.39 
 
 		 701 aa  88.2  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.269245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 686 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 686 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  23.36 
 
 		 745 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  23.36 
 
 		 745 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1772  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 264 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  29.5 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  24.37 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 773 aa  67  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 538 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  29.5 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  27.48 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  28.47 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 532 aa  64.3  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4523  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 494 aa  63.9  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.027207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  31.3 
 
 		 118 aa  63.9  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 338 aa  63.9  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 535 aa  63.9  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 296 aa  63.9  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 319 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 259 aa  63.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 296 aa  63.9  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 319 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 502 aa  63.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  28.45 
 
 		 296 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  26.02 
 
 		 304 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 304 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 322 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 319 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 319 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 319 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 359 aa  62  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3526  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 266 aa  62  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0204519  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  27.64 
 
 		 297 aa  62  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 		 304 aa  62  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  29.59 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  28.43 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  29.59 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  29.59 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  29.59 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  29.59 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1509  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4820  AraC family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0920  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0175793  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  29.59 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0419  arac-family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000111496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4087  two component transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 350 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 386 aa  60.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 356 aa  60.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 273 aa  60.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  31.25 
 
 		 301 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  31.25 
 
 		 287 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  25.29 
 
 		 299 aa  60.1  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  28.43 
 
 		 300 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 298 aa  59.7  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 309 aa  59.3  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  28.87 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 298 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0029  DNA-binding transcriptional regulator AraC  30.53 
 
 		 242 aa  59.3  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.773429  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  27.37 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2238  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000454466 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3152  sigma-54 factor, interaction region  30.1 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1007  AraC family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1639  AraC family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  24.24 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  27.84 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3229  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.686696 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  27.4 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01433  transcriptional regulator  23.57 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738294  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1312  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03989  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.69 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3874  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3909  DNA-binding transcriptional regulator MelR  30.69 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5632  DNA-binding transcriptional regulator MelR  30.69 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4359  DNA-binding transcriptional regulator MelR  30.69 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4584  DNA-binding transcriptional regulator MelR  30.69 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03950  hypothetical protein  30.69 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>