190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0541 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0528  RNA-binding S4 domain-containing protein  100 
 
 		 87 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000233006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0541  RNA-binding S4 domain-containing protein  100 
 
 		 87 aa  172  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000262722  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0144  S4 domain-containing protein  75.58 
 
 		 87 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  72.62 
 
 		 91 aa  122  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  70.11 
 
 		 93 aa  119  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  69.05 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  69.05 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  69.05 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  69.05 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  69.05 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  69.05 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  69.05 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  69.05 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  69.05 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  70.24 
 
 		 91 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  69.41 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0012  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  61.63 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  60.98 
 
 		 93 aa  103  7e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0010  S4 domain-containing protein  57.65 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  62.03 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  56.47 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  62.82 
 
 		 79 aa  100  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000195193  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  60.49 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3084  RNA-binding S4 domain protein  57.89 
 
 		 79 aa  97.4  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000350444  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  56.25 
 
 		 86 aa  96.7  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000325164  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  56.25 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000568506  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  58.02 
 
 		 81 aa  94.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  52.5 
 
 		 80 aa  93.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000916676  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  51.76 
 
 		 86 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  53.16 
 
 		 100 aa  87.8  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  51.76 
 
 		 89 aa  87  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  51.25 
 
 		 80 aa  84  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  52.5 
 
 		 91 aa  84  6e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.75 
 
 		 88 aa  84  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.43 
 
 		 79 aa  83.6  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.25 
 
 		 80 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  40.96 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0164  S4 domain protein  45 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0343  RNA-binding S4 domain protein  45 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  44.44 
 
 		 81 aa  70.5  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  36.9 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000180321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  42.5 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.05 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.86 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  41.98 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  46.03 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  41.46 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.24 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.46 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1237  uroporphyrinogen decarboxylase  47.06 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  39.51 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0753  S4 RNA-binding domain protein  37.66 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  37.66 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  37.66 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.18 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  36.36 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  45.1 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  43.08 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  38.46 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1959  RNA-binding S4 domain protein  36.14 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0257024  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0879  RNA-binding S4 domain protein  40.32 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  37.88 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1066  S4 domain-containing protein  35 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  36.9 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0505  RNA-binding S4  36.59 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0154787  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1468  RNA-binding S4  39.77 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.369867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2572  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.88 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000329633 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0249  RNA-binding S4 domain protein  34.15 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0250  RNA-binding S4 domain protein  34.07 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0157296 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4593  heat shock protein 15  38.24 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0725  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1559  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.18 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.200208  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3813  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.9 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0701  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00584893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.68 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0265  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.07 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.664213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1408  RNA-binding S4 domain protein  41.27 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0275  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.07 
 
 		 133 aa  47.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0850  S4 domain-containing protein  38.1 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00127812  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0095  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.39 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0776  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.72 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00252001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05160  heat shock protein implicated in 50S component recycling (S4 paralogue)  35.71 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0946751  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  35.9 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.37 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1720  RNA-binding S4 domain protein  35.37 
 
 		 93 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485798  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4615  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.8 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0019  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.7 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.329407  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1038  RNA-binding S4  35.19 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3696  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.9 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0328  RNA-binding S4 domain protein  33.33 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0170  RNA-binding S4  39.06 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0410  RNA-binding S4  30.77 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.553472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3872  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  37.88 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4962  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.97 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3778  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  37.88 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1769  S4 domain-containing protein  34.62 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00186229  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0237  heat shock protein 15  37.5 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3769  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.9 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.594721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0265  RNA-binding S4  37.5 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293458 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3694  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  35.9 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>