More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0510 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0510  trehalose operon repressor  100 
 
 
242 aa  491  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0497  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
242 aa  491  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 
246 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  37.02 
 
 
236 aa  151  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  36.17 
 
 
236 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  36.17 
 
 
236 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 
237 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  36.6 
 
 
236 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1339  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
240 aa  150  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.344054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  36.17 
 
 
236 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  35.74 
 
 
236 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  35.74 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  35.74 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  35.32 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
236 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0510  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
240 aa  139  4.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  33.76 
 
 
235 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  33.76 
 
 
235 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0076  transcriptional regulator, GntR family  33.76 
 
 
235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.15859  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0480  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00570822  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0534  transcriptional regulator  34.6 
 
 
300 aa  130  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.207932  hitchhiker  0.0000000000234574 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0603  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 
239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.971454  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2016  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 
242 aa  108  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.47195  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1334  transcriptional regulator, GntR family  31.06 
 
 
239 aa  100  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  decreased coverage  0.000248139 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 
244 aa  86.7  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  31.76 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  31.18 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  24.57 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  28.15 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  24.46 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  27.19 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  24.89 
 
 
245 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  24.89 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  24.46 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 
245 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  24.46 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  25.43 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  24.46 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  24.46 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  24.46 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  26.58 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  25.31 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  24.58 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  24.23 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  24.59 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  24.59 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  24.59 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  24.59 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  24.59 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
256 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
256 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  24.59 
 
 
240 aa  72  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  33.59 
 
 
245 aa  72  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0188  transcriptional regulator  26.52 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0560306 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  23.5 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3202  transcriptional regulator, GntR family  26.89 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  24.18 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  31.39 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  24.69 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  24.57 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  23.79 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  23.79 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  23.79 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  23.79 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  22.92 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  23.79 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  23.77 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  26.54 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  26.54 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  24.47 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.59 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  28.25 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  26.09 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  28.25 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>