115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0138 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  791    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  791    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  29.61 
 
 		 399 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  28.23 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  27.91 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  28.12 
 
 		 395 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  26.27 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  27.84 
 
 		 356 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  29.09 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  25.91 
 
 		 359 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  26.05 
 
 		 404 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  26.51 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  28.27 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  26.73 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  26.77 
 
 		 350 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  23.68 
 
 		 401 aa  97.8  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  24.77 
 
 		 372 aa  97.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  24.27 
 
 		 355 aa  97.1  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  27.59 
 
 		 372 aa  96.7  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  26.89 
 
 		 383 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  26.1 
 
 		 366 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  25.73 
 
 		 372 aa  92.8  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  25.07 
 
 		 352 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  25 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  28.44 
 
 		 349 aa  90.9  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  23.84 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  24.87 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  27.47 
 
 		 386 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  25.78 
 
 		 356 aa  86.7  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  24.92 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  30.94 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  30.56 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  24.34 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  25.62 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  25.62 
 
 		 367 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  23.82 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  24.92 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  24.34 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  25 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  24.71 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  22.02 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4968  helix-turn-helix domain-containing protein  26.51 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0119707 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  23.73 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  30.56 
 
 		 182 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  37.25 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  28.49 
 
 		 173 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  28.37 
 
 		 175 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 396 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  28.95 
 
 		 393 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  26.39 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  30.26 
 
 		 322 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  26.62 
 
 		 393 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2477  protein of unknown function DUF955  28.93 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  37.5 
 
 		 285 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  22.89 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  31.07 
 
 		 186 aa  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000214852  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  31.53 
 
 		 422 aa  49.7  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1505  hypothetical protein  27.17 
 
 		 383 aa  49.7  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  25 
 
 		 410 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4638  protein of unknown function DUF955  25.81 
 
 		 224 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  30.51 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  21.85 
 
 		 383 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  28.39 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  27.95 
 
 		 291 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0814  helix-turn-helix domain-containing protein  22.03 
 
 		 425 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00469966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0511  hypothetical protein  27.36 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5417  hypothetical protein  27.36 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198683 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  34.07 
 
 		 289 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5397  hypothetical protein  27.36 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.69326 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2518  protein of unknown function DUF955  25.7 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.010681 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1728  protein of unknown function DUF955  35.04 
 
 		 331 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2984  helix-turn-helix domain protein  25.17 
 
 		 348 aa  47.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0858456  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 197 aa  47  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2541  protein of unknown function DUF955  25 
 
 		 295 aa  47  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.24198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  21.38 
 
 		 135 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  28.04 
 
 		 270 aa  46.6  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  28 
 
 		 206 aa  46.6  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0018  helix-turn-helix domain protein  21 
 
 		 347 aa  46.6  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  33.68 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2248  hypothetical protein  31.03 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0302018  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  34.25 
 
 		 216 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 145 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  40 
 
 		 186 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1825  hypothetical protein  31.33 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 142 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 123 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0651  hypothetical protein  30.1 
 
 		 215 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  31.39 
 
 		 156 aa  44.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1835  hypothetical protein  31.33 
 
 		 286 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0704752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  34.09 
 
 		 277 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  30.61 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0915  hypothetical protein  39.22 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.938831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1309  hypothetical protein  29.69 
 
 		 284 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.584713  normal  0.697402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2482  protein of unknown function DUF955  28.29 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  24.24 
 
 		 382 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  28.4 
 
 		 139 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  32.65 
 
 		 261 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  32.88 
 
 		 216 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>