More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0126 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0121  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 251 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000430087  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0126  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 251 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0616081  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1491  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0628675  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1280  transcriptional regulator  35.25 
 
 		 249 aa  148  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000081725  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0369  transcriptional regulator  27.82 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0374  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2073  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0165652  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4496  GntR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4790  GntR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4409  GntR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  28.65 
 
 		 233 aa  72  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1785  regulatory protein GntR, HTH  50 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.711067  normal  0.392955 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1119  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4965  regulatory protein GntR, HTH  45.78 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  44.62 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0617  transcriptional regulator, GntR family  47.14 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4083  GntR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  30.19 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1409  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  37.08 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  29.2 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2915  GntR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5518  transcriptional regulator, GntR family  28.66 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0560672  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4206  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  48.33 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0752  transcriptional regulator, GntR family  43.08 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00012009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  41.79 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  39.71 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0086  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 126 aa  62  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5461  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1484  transcriptional regulator, GntR family  40.3 
 
 		 244 aa  62  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  42.42 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.42 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  42.42 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6358  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 		 127 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3509  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393643  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  42.42 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  42.42 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  42.42 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  42.42 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  42.42 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0853  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.122159  hitchhiker  0.00270002 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  33.72 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  33.72 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  34.55 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4783  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  48.48 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.113518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  44.12 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  30.68 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  38.67 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  39.06 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  36.78 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  38.81 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0497  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1509  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0510  trehalose operon repressor  40.58 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2588  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0471  2-aminoethylphosphonate transport, repressor  38.24 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0342  GntR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0407848  hitchhiker  0.000377769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>