More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0114 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0114  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 400 aa  835    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 400 aa  835    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00881  diaminopimelate decarboxylase protein  47.57 
 
 		 413 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.68 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585964  normal  0.770001 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0584  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.09 
 
 		 405 aa  344  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000391397  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4782  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.31 
 
 		 408 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0717  diaminopimelate decarboxylase  43.39 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0591874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3735  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  40.21 
 
 		 388 aa  324  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0413562  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.3 
 
 		 392 aa  323  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001062  vibrioferrin decarboxylase protein PvsE  42.03 
 
 		 400 aa  322  6e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6954  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.8 
 
 		 403 aa  316  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160275  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01927  diaminopimelate decarboxylase  40.31 
 
 		 398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3096  diaminopimelate decarboxylase  39.69 
 
 		 394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4867  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.56 
 
 		 373 aa  296  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155396  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1275  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  40.5 
 
 		 421 aa  296  6e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.548043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09300  diaminopimelate decarboxylase  40.56 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000620759  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2585  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2:Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.3 
 
 		 402 aa  292  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.126508  decreased coverage  0.000677908 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2676  Diaminopimelate decarboxylase  39.49 
 
 		 418 aa  290  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.438266  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2972  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.57 
 
 		 362 aa  256  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.980745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8366  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.99 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0663  diaminopimelate decarboxylase  31.91 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4053  diaminopimelate decarboxylase  30.87 
 
 		 484 aa  193  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.2 
 
 		 416 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  29.67 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0126  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.61 
 
 		 411 aa  177  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1957  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.1 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7006  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  30 
 
 		 408 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015439 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2669  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.23 
 
 		 410 aa  169  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.499942  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1565  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.35 
 
 		 411 aa  169  7e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2528  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  30.89 
 
 		 416 aa  169  8e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0397628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.69 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0700  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.19 
 
 		 414 aa  162  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1835  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.26 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.59311  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2435  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.4 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.22 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.94 
 
 		 431 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.65 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  29.49 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2019  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.95 
 
 		 419 aa  159  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.225254 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4274  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  29.61 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3058  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.65 
 
 		 418 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.700588  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.84 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.32 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3805  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.84 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0421  putative Orn/DAP/Arg decarboxylase  28.21 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.72 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.24 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  27.79 
 
 		 423 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  29.35 
 
 		 451 aa  143  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  27.52 
 
 		 423 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.12 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.61 
 
 		 508 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00597643  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1290  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.52 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1929  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.89 
 
 		 409 aa  133  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  27.34 
 
 		 414 aa  132  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  27.25 
 
 		 418 aa  132  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  27.85 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  28.72 
 
 		 443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  29.49 
 
 		 443 aa  130  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  27.66 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  27.66 
 
 		 414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  28.35 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  28.05 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  28.35 
 
 		 422 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  27.5 
 
 		 420 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  27.37 
 
 		 421 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  27.39 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  26.84 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  27.85 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  28.86 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  27.62 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4073  diaminopimelate decarboxylase  27.06 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  28.68 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2188  diaminopimelate decarboxylase  28.53 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  28.42 
 
 		 415 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  27.17 
 
 		 417 aa  126  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  27.91 
 
 		 421 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  27.39 
 
 		 419 aa  126  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0681  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.91 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  26.88 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2332  diaminopimelate decarboxylase  27.35 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.247782  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  28.25 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  26.23 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  28.14 
 
 		 415 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  26.77 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3135  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.39 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  26.49 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4492  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  27.89 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.799972  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  26.33 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1199  diaminopimelate decarboxylase  25.92 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0292186  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  27.67 
 
 		 422 aa  123  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  27.4 
 
 		 421 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  27.6 
 
 		 402 aa  123  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  27.49 
 
 		 417 aa  123  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5498  diaminopimelate decarboxylase  28.74 
 
 		 415 aa  123  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2337  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.44 
 
 		 408 aa  123  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  25.78 
 
 		 414 aa  123  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  26.1 
 
 		 427 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  28.11 
 
 		 422 aa  122  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  27.11 
 
 		 416 aa  122  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>