259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0113 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0109  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
259 aa  528  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0113  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
259 aa  528  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2673  HpcH/HpaI aldolase  48.02 
 
 
258 aa  247  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2588  HpcH/HpaI aldolase  45.7 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0901158  hitchhiker  0.00712215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4781  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  48.62 
 
 
259 aa  241  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131567  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0716  putative aldolase  47.43 
 
 
253 aa  211  7e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0565774 
 
 
-
 
NC_003296  RS00880  aldolase protein  42.91 
 
 
267 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0143693  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1111  HpcH/HpaI aldolase  43.5 
 
 
251 aa  191  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0589091  normal  0.717046 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0585  HpcH/HpaI aldolase  40.48 
 
 
259 aa  179  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170473  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6953  HpcH/HpaI aldolase  36.59 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3089  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  36.95 
 
 
256 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0555789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3135  HpcH/HpaI aldolase  35.48 
 
 
254 aa  159  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09360  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase, HpcH/HpaI family  35.41 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2821  HpcH/HpaI aldolase  33.9 
 
 
254 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1540  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  35.93 
 
 
264 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01933  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  35.47 
 
 
253 aa  122  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7095  HpcH/HpaI aldolase  30.68 
 
 
256 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.859746  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0810  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.6 
 
 
256 aa  119  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0871  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  31.66 
 
 
266 aa  119  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0844  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.2 
 
 
256 aa  118  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3771  HpcH/HpaI aldolase  32.77 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635627  normal  0.155123 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2073  HpcH/HpaI aldolase  28.17 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3232  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.83 
 
 
257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3604  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.83 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4438  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.83 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.867031  normal  0.323849 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3421  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.83 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2181  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.75 
 
 
272 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02555  hypothetical protein  30.08 
 
 
249 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0574  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.83 
 
 
256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02991  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.83 
 
 
256 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0579  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  29.83 
 
 
256 aa  112  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02942  hypothetical protein  29.83 
 
 
256 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3315  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.83 
 
 
256 aa  112  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1457  HpcH/HpaI aldolase  33.19 
 
 
279 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09230  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.25 
 
 
301 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.380791  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3740  HpcH/HpaI aldolase  32.49 
 
 
250 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3568  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  29.83 
 
 
256 aa  112  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.809818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2482  HpcH/HpaI aldolase  31.58 
 
 
254 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3014  putative aldolase protein  32.49 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1122  HpcH/HpaI aldolase  34.45 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.597094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3855  HpcH/HpaI aldolase  28.45 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3442  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.67 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3608  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.67 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal  0.699221 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3511  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.67 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3547  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.67 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293862  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2034  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase(HpaI)  30.11 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0580276  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3439  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  30.67 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1595  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.02 
 
 
255 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3485  HpcH/HpaI aldolase  30.54 
 
 
249 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.547567  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3554  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  27.6 
 
 
256 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1422  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  27.48 
 
 
256 aa  110  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0413862 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4034  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  31.65 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0974  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  32.38 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3911  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  33.64 
 
 
293 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0068475  normal  0.0363616 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6846  HpcH/HpaI aldolase  34.05 
 
 
265 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0292  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.04 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419206  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8637  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.57 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3394  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  27.6 
 
 
256 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6467  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  37.63 
 
 
261 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2470  HpcH/HpaI aldolase  32.04 
 
 
248 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4446  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.78 
 
 
268 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0830561 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00240  aldolase, putative  29.07 
 
 
267 aa  106  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5830  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.98 
 
 
267 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465681  normal  0.396851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2633  putative aldolase  31.32 
 
 
267 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.952271  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1881  HpcH/HpaI aldolase  29.25 
 
 
254 aa  105  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2425  putative aldolase  31.32 
 
 
267 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2517  putative aldolase  31.32 
 
 
267 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343129  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3886  HpcH/HpaI aldolase  30.74 
 
 
262 aa  105  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.21023  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6527  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  29.06 
 
 
261 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.098717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2529  putative aldolase  30.27 
 
 
267 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.388708  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2474  putative aldolase  30.27 
 
 
267 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4400  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  32.49 
 
 
265 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.125493  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3054  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  36.56 
 
 
261 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3145  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  29.77 
 
 
253 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.462882  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1896  HpcH/HpaI aldolase  32.23 
 
 
268 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3171  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  36.56 
 
 
261 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.537905  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1599  alpha-dehydro-beta-deoxy-D-glucarate aldolase  28.05 
 
 
260 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0475  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.54 
 
 
266 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02171  predicted 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.69 
 
 
267 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1413  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.69 
 
 
267 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638548  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1156  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase, putative  28.29 
 
 
269 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2387  putative aldolase  31.69 
 
 
267 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02130  hypothetical protein  31.69 
 
 
267 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4135  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.34 
 
 
253 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.960195  normal  0.819537 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1060  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.29 
 
 
269 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.582352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1404  putative aldolase  31.69 
 
 
267 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.174017  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1411  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  30.21 
 
 
255 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0315815  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2830  HpcH/HpaI aldolase  28.29 
 
 
273 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2399  putative aldolase  31.28 
 
 
267 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4475  HpcH/HpaI aldolase  30.56 
 
 
273 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000552793 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5698  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  30.52 
 
 
272 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3113  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  33.82 
 
 
261 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0507  putative HpcH/HpaI aldolase  26.72 
 
 
253 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208943  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3463  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  31.09 
 
 
254 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6606  HpcH/HpaI aldolase  31.09 
 
 
274 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6205  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  29.71 
 
 
256 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.424474  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1776  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  28.51 
 
 
254 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.170992  normal  0.538418 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3223  2-dehydro-3-deoxyglucarate aldolase  33.33 
 
 
266 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4133  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.02 
 
 
267 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148585  normal  0.769633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3456  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.13 
 
 
254 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>