42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0102 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0102  cell wall anchor domain-containing protein  100 
 
 
520 aa  1027  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0098  cell wall anchor domain-containing protein  100 
 
 
520 aa  1027  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2444  Ig-binding B domain-containing protein  34.87 
 
 
436 aa  82  2e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2492  Ig-binding B domain-containing protein  34.87 
 
 
436 aa  82  2e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3231  hypothetical protein  37.5 
 
 
382 aa  62  2e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3232  hypothetical protein  35 
 
 
382 aa  61.2  5e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  45.24 
 
 
2272 aa  58.2  4e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  36.14 
 
 
2179 aa  57  8e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3267  hypothetical protein  34.15 
 
 
537 aa  55.1  3e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0776  collagen-binding surface protein  37.89 
 
 
913 aa  54.3  5e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133047  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  54.76 
 
 
204 aa  53.1  1e-05  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0662  hypothetical protein  29.75 
 
 
444 aa  53.1  1e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00226884  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  40.3 
 
 
1556 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  42.11 
 
 
307 aa  50.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  3.33433e-07 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0583  putative lipoprotein  56.9 
 
 
754 aa  48.9  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.91 
 
 
543 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  4.44434e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0326  muramidase  50 
 
 
372 aa  47.8  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000174883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  44.87 
 
 
2136 aa  47.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.47 
 
 
971 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  32.5 
 
 
414 aa  47.4  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0585  putative lipoprotein  44.68 
 
 
111 aa  47  0.0008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  29.27 
 
 
568 aa  47  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  5.6221e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  60.98 
 
 
1337 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  60.98 
 
 
1337 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2380  hypothetical protein  37.82 
 
 
473 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484558  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.67 
 
 
327 aa  46.2  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4394  helicase domain-containing protein  25.97 
 
 
1140 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3176  lysM domain-containing protein  31.58 
 
 
305 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  60.98 
 
 
1153 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 
128 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  60.98 
 
 
1153 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  48.28 
 
 
969 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  42.31 
 
 
184 aa  45.8  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  48.28 
 
 
969 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0272  hypothetical protein  33.96 
 
 
310 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 
159 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  43.48 
 
 
1197 aa  43.9  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  51.22 
 
 
445 aa  43.9  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  38.3 
 
 
522 aa  43.9  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  42.86 
 
 
746 aa  43.5  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  45.45 
 
 
428 aa  43.5  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1186  Slt family transglycosylase  46.15 
 
 
398 aa  43.5  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>