20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0072 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0072    100 
 
 
422 bp  837  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.570912  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0069    100 
 
 
422 bp  837  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0079  hypothetical protein  96.94 
 
 
987 bp  617  1e-174  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0077  hypothetical protein  96.94 
 
 
987 bp  617  1e-174  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2413  hypothetical protein  81.94 
 
 
981 bp  157  3e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1438  hypothetical protein  96.97 
 
 
189 bp  115  1e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000726754  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1411  hypothetical protein  96.97 
 
 
189 bp  115  1e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000320371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1493  hypothetical protein  96.72 
 
 
240 bp  105  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0835    96.72 
 
 
243 bp  105  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00748272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4937  probable tRNA-dihydrouridine synthase 2  86.05 
 
 
990 bp  75.8  9e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00645235  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0302  dihydrouridine synthase  85 
 
 
990 bp  63.9  3e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0382  hypothetical protein  85 
 
 
990 bp  63.9  3e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00282008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0408  hypothetical protein  84.52 
 
 
990 bp  63.9  3e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0366  hypothetical protein  92.68 
 
 
990 bp  58  2e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0314  dihydrouridine synthase DuS  83.75 
 
 
990 bp  56  8e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0334  hypothetical protein  83.75 
 
 
990 bp  56  8e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0426  hypothetical protein  83.33 
 
 
990 bp  56  8e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0319  hypothetical protein  83.75 
 
 
990 bp  56  8e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0306  dihydrouridine synthase  83.33 
 
 
990 bp  56  8e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1522  hypothetical protein  96.43 
 
 
132 bp  48.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>