40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0065 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2483  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  612  1e-174  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0065  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  612  1e-174  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  61.27 
 
 
597 aa  371  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  60.21 
 
 
597 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  60.21 
 
 
597 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  37.14 
 
 
582 aa  68.6  1e-10  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  33.33 
 
 
658 aa  68.9  1e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  29.63 
 
 
890 aa  65.1  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  30.2 
 
 
890 aa  65.1  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  32.17 
 
 
689 aa  64.3  3e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  34.53 
 
 
591 aa  63.5  4e-09  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  30.71 
 
 
950 aa  62  1e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  30.71 
 
 
955 aa  62  1e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  30.71 
 
 
953 aa  62  1e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  30.71 
 
 
950 aa  62  1e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  30.71 
 
 
958 aa  62  1e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  30.71 
 
 
958 aa  62  1e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  33.81 
 
 
1051 aa  61.6  2e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  30.71 
 
 
955 aa  61.2  2e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  32.39 
 
 
574 aa  60.5  4e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  30.66 
 
 
953 aa  60.5  4e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  43.18 
 
 
631 aa  59.7  6e-08  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  35.71 
 
 
895 aa  58.9  9e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  6.96733e-12 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  31.21 
 
 
515 aa  58.2  1e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  31.39 
 
 
979 aa  56.6  5e-07  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  35.42 
 
 
930 aa  56.6  5e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  28.57 
 
 
633 aa  56.2  6e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  35 
 
 
676 aa  53.9  3e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  24.32 
 
 
842 aa  53.9  3e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  37.08 
 
 
580 aa  52.8  7e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2984  superfamily II helicase  24.14 
 
 
624 aa  51.6  2e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.421436  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  27.4 
 
 
911 aa  51.2  2e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  34.78 
 
 
841 aa  51.6  2e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  26.62 
 
 
556 aa  49.3  8e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  29.14 
 
 
553 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  23.6 
 
 
709 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  34.12 
 
 
627 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.19 
 
 
970 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  30.19 
 
 
970 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  31.46 
 
 
845 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>