48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0051 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  100 
 
 
597 aa  1230  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  100 
 
 
597 aa  1230  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  96.82 
 
 
597 aa  1194  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0065  hypothetical protein  60.21 
 
 
298 aa  365  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2483  hypothetical protein  60.21 
 
 
298 aa  365  1e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2484  hypothetical protein  49.47 
 
 
289 aa  289  1e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0064  hypothetical protein  49.47 
 
 
289 aa  289  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  23.29 
 
 
842 aa  90.9  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  32.3 
 
 
658 aa  79  2e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  25.53 
 
 
633 aa  79  2e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  23.6 
 
 
689 aa  77.8  5e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  25.61 
 
 
631 aa  77.4  7e-13  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  26.98 
 
 
582 aa  76.6  1e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  23.62 
 
 
953 aa  75.5  2e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  23.19 
 
 
890 aa  74.7  4e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  32.96 
 
 
591 aa  75.1  4e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  23.19 
 
 
890 aa  74.7  5e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  23.25 
 
 
958 aa  73.9  7e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  23.25 
 
 
958 aa  73.9  7e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  23.4 
 
 
979 aa  73.2  1e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  23.25 
 
 
950 aa  73.2  1e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  23.25 
 
 
955 aa  73.2  1e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  30.48 
 
 
574 aa  73.2  1e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  23.25 
 
 
950 aa  72.4  2e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  22.88 
 
 
953 aa  72.4  2e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  26.32 
 
 
911 aa  71.6  4e-11  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2984  superfamily II helicase  25.08 
 
 
624 aa  71.2  4e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.421436  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  26.85 
 
 
580 aa  68.9  2e-10  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  23.81 
 
 
556 aa  68.9  2e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  22.22 
 
 
895 aa  67.8  5e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  6.96733e-12 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  26.84 
 
 
930 aa  67.4  8e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  30.94 
 
 
1051 aa  66.6  1e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  21.77 
 
 
955 aa  65.9  2e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  27.88 
 
 
676 aa  64.3  6e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  30.3 
 
 
841 aa  64.3  7e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  21.21 
 
 
709 aa  62  3e-08  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  25 
 
 
627 aa  61.6  4e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  23.53 
 
 
515 aa  60.5  8e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  23.86 
 
 
553 aa  58.5  3e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  26.06 
 
 
929 aa  53.5  1e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  24.04 
 
 
970 aa  51.2  5e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  23.63 
 
 
970 aa  51.2  6e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  22.41 
 
 
711 aa  50.4  8e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  24.63 
 
 
899 aa  50.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.65 
 
 
713 aa  50.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  1.09484e-07 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  25.99 
 
 
878 aa  49.3  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  21.83 
 
 
897 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  27.36 
 
 
845 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>