More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0043 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  100 
 
 
361 aa  740  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  100 
 
 
361 aa  740  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  100 
 
 
361 aa  740  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  100 
 
 
361 aa  740  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  100 
 
 
361 aa  740  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  100 
 
 
361 aa  740  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  100 
 
 
361 aa  740  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  73.06 
 
 
361 aa  561  1e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  45.43 
 
 
373 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3147  Tn554-related, transposase A  42.62 
 
 
372 aa  245  7e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85236  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  38.03 
 
 
367 aa  236  5e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  36.87 
 
 
395 aa  229  8e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  37.94 
 
 
364 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  37.94 
 
 
364 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  38.79 
 
 
344 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  37.02 
 
 
370 aa  223  5e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  3.54684e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  36.6 
 
 
384 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3734  phage integrase-like SAM-like  37.62 
 
 
323 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  38.41 
 
 
312 aa  199  7e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0242  Tn554-related, transposase A  41.69 
 
 
519 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3803  phage integrase family protein  31.2 
 
 
388 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704516  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1934  phage integrase  31.2 
 
 
388 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3970  phage integrase family protein  31.2 
 
 
388 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  26.63 
 
 
385 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0512  phage integrase family protein  24.42 
 
 
399 aa  120  4e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5418  phage integrase family protein  24.42 
 
 
399 aa  120  4e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5398  phage integrase family protein  24.42 
 
 
399 aa  120  4e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1426  phage integrase family protein  24.55 
 
 
401 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3603  integrase family protein  26.09 
 
 
393 aa  115  1e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185249  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3698  integrase family protein  26.09 
 
 
393 aa  115  1e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0843425  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3044  integrase family protein  26.09 
 
 
393 aa  115  1e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169579  hitchhiker  0.00511814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3585  integrase family protein  26.09 
 
 
393 aa  115  1e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0961554  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1215  integrase family protein  26.09 
 
 
393 aa  115  1e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0266422  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3469  integrase family protein  26.09 
 
 
393 aa  115  1e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00208728  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3740  integrase family protein  26.09 
 
 
393 aa  115  1e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0478  phage integrase family protein  24.8 
 
 
393 aa  109  7e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3896  phage integrase family protein  24.8 
 
 
393 aa  109  7e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5935  phage integrase family protein  24.8 
 
 
393 aa  109  7e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3904  phage integrase family protein  24.8 
 
 
393 aa  109  7e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156918  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5497  phage integrase family protein  23.82 
 
 
349 aa  109  9e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.052501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3589  phage integrase family protein  23.82 
 
 
349 aa  109  9e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0455  phage integrase family protein  23.82 
 
 
349 aa  109  9e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2585  integrase family protein  25.71 
 
 
324 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4728  integrase family protein  25.71 
 
 
324 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2670  integrase family protein  25.71 
 
 
324 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  27.11 
 
 
360 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  27.49 
 
 
285 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3706  integrase family protein  25.48 
 
 
334 aa  95.9  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000354013  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1237  integrase family protein  25.48 
 
 
334 aa  95.9  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2522  integrase family protein  25.48 
 
 
334 aa  95.9  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  3.59584e-05  hitchhiker  0.00166754 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  25.15 
 
 
286 aa  94.7  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  24.49 
 
 
364 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  29.7 
 
 
291 aa  90.5  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 
295 aa  90.1  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2147  phage integrase  24.73 
 
 
411 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3532  phage integrase  24.73 
 
 
411 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.346968  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  31.58 
 
 
284 aa  89.7  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2972  phage integrase family protein  24.36 
 
 
411 aa  86.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4792  phage integrase family protein  24.36 
 
 
411 aa  86.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2265  phage integrase family protein  24.36 
 
 
411 aa  86.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  27.02 
 
 
302 aa  83.6  4e-15  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.74 
 
 
295 aa  83.6  4e-15  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  28.05 
 
 
295 aa  82  1e-14  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  25.21 
 
 
310 aa  82.4  1e-14  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  25.45 
 
 
299 aa  82.4  1e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1002  phage integrase  29.41 
 
 
408 aa  81.6  2e-14  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.606138  decreased coverage  0.00492215 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.49 
 
 
298 aa  80.9  3e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6252  phage integrase-like SAM-like  25.56 
 
 
381 aa  80.9  3e-14  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  29.38 
 
 
270 aa  80.1  6e-14  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0431  phage integrase  25.99 
 
 
291 aa  79.7  7e-14  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.173073 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  26.52 
 
 
290 aa  79.7  7e-14  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.41 
 
 
299 aa  78.2  2e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.83 
 
 
363 aa  78.2  2e-13  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0506  phage integrase family protein  29.1 
 
 
424 aa  78.2  2e-13  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  31.95 
 
 
386 aa  77.8  3e-13  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  24.78 
 
 
302 aa  77.4  3e-13  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  24.49 
 
 
302 aa  77.4  3e-13  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  30.21 
 
 
190 aa  76.6  7e-13  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.08 
 
 
328 aa  76.6  7e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.79914e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.27 
 
 
296 aa  75.5  1e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.27 
 
 
296 aa  75.5  1e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  33.52 
 
 
378 aa  75.9  1e-12  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.27 
 
 
296 aa  75.5  1e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.27 
 
 
296 aa  75.5  1e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.27 
 
 
296 aa  75.5  1e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.27 
 
 
296 aa  75.5  1e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.27 
 
 
296 aa  75.5  1e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  28.17 
 
 
296 aa  75.5  1e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.27 
 
 
296 aa  75.5  1e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  23.91 
 
 
302 aa  75.5  1e-12  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.27 
 
 
296 aa  75.5  1e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  25.4 
 
 
273 aa  74.7  2e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  26.01 
 
 
274 aa  75.5  2e-12  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.52 
 
 
282 aa  75.1  2e-12  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  26.69 
 
 
320 aa  75.1  2e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  26.01 
 
 
321 aa  75.1  2e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.13 
 
 
301 aa  74.3  3e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.89449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.71 
 
 
296 aa  74.3  3e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  3.17777e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.71 
 
 
296 aa  74.3  3e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  28.06 
 
 
328 aa  74.3  3e-12  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>