34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0041 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1222  Tn554, transposase C  100 
 
 
125 aa  245  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.406172  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1715  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  245  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0041  transposase C  100 
 
 
125 aa  245  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1749  transposase C  100 
 
 
125 aa  245  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0515142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0041  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  245  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1345  Tn554, transposase C  100 
 
 
125 aa  245  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.48527  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2508  transposase C  100 
 
 
125 aa  245  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4538  transposase C  59.04 
 
 
90 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3149  Tn554-related, transposase C  40.95 
 
 
126 aa  78.6  3e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0002  Tn554-related, transposase C  40.95 
 
 
126 aa  78.6  3e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00851987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4148  hypothetical protein  37.61 
 
 
167 aa  73.2  1e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1706  Tn554 transposase C  33.9 
 
 
136 aa  69.3  2e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428183  normal  0.726116 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5579  Tn554 transposase C  33.9 
 
 
136 aa  69.3  2e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142757  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5982  Tn554 transposase C  33.9 
 
 
136 aa  69.3  2e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100024 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20680  hypothetical protein  29.66 
 
 
129 aa  64.3  6e-10  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0988  Tn554-related, transposase C  38.82 
 
 
131 aa  57.4  6e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.167776  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1464  Tn554-related, transposase C  47.12 
 
 
121 aa  57  9e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  1.6421e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0694  Tn554-related, transposase C  31.15 
 
 
147 aa  55.1  4e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0480  Tn554-related, transposase C  27.64 
 
 
147 aa  54.7  4e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170868  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5933  Tn554-related, transposase C  27.64 
 
 
147 aa  54.7  4e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3902  Tn554-related, transposase C  27.64 
 
 
147 aa  54.7  4e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3898  Tn554-related, transposase C  27.64 
 
 
147 aa  54.7  4e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.768404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2145  Tn554 transposase C  25 
 
 
135 aa  51.6  4e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3700  hypothetical protein  28.41 
 
 
151 aa  50.4  7e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3605  hypothetical protein  28.41 
 
 
151 aa  50.4  7e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438159  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3587  hypothetical protein  28.41 
 
 
151 aa  50.4  7e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00101859  hitchhiker  0.00420892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3467  hypothetical protein  28.41 
 
 
151 aa  50.4  7e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  7.14931e-06  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3042  hypothetical protein  28.41 
 
 
151 aa  50.4  7e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.11872e-06  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1217  hypothetical protein  28.41 
 
 
151 aa  50.4  7e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471873  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3742  hypothetical protein  28.41 
 
 
151 aa  50.4  7e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.165817  normal  0.166782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5420  Tn554 transposase C  26.98 
 
 
144 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5400  Tn554 transposase C  26.98 
 
 
144 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.322304 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0070  hypothetical protein  34.25 
 
 
148 aa  43.5  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1115  hypothetical protein  25.27 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278395  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>