38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0040 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1748  3'-adenylyltransferase  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.193296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0040  3'-adenylyltransferase  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1714  3''-adenylyltransferase  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0040  3''-adenylyltransferase  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1221  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1344  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.166071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2509  streptomycin 3''-adenylyltransferase  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0956  3''-adenylyltransferase  69.05 
 
 
260 aa  360  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2808  DNA polymerase beta domain protein region  64.62 
 
 
272 aa  349  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1735  adenylyltransferase  43.6 
 
 
278 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000530526  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5877  streptomycin 3''-adenylyltransferase  37.6 
 
 
260 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5656  3''-adenylyltransferase  38.37 
 
 
269 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2178  aminoglycoside resistance protein  40.16 
 
 
295 aa  184  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120718  normal  0.0590756 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0135  aminoglycoside resistance protein  36.02 
 
 
267 aa  182  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0065  aminoglycoside resistance protein  36.02 
 
 
263 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.577085 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0144  aminoglycoside resistance protein  35.63 
 
 
335 aa  182  4e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.397995  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0063  aminoglycoside resistance protein  34.48 
 
 
263 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4803  adenylyltransferase  44.44 
 
 
236 aa  178  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318391  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1370  aminoglycoside resistance protein  33.59 
 
 
289 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  hitchhiker  0.000262093 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1916  aminoglycoside resistance protein  33.59 
 
 
289 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  4.83855e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1354  aminoglycoside resistance protein  33.59 
 
 
289 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000229675  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1385  aminoglycoside resistance protein  33.59 
 
 
289 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.206124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2105  aminoglycoside resistance protein  34.35 
 
 
263 aa  165  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3549  aminoglycoside resistance protein  34.22 
 
 
327 aa  163  2e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0092  hypothetical protein  35.32 
 
 
273 aa  162  4e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.479287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20670  nucleotidyltransferase family protein  36.89 
 
 
254 aa  130  2e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117962  normal  0.282766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0978  hypothetical protein  28.63 
 
 
284 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1803  DNA polymerase beta domain protein region  25.56 
 
 
254 aa  81.6  1e-14  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3874  streptomycin 3''-adenylyltransferase  28.85 
 
 
151 aa  76.3  5e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0636766  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3372  streptomycin 3''-adenylyltransferase  34.26 
 
 
131 aa  75.9  7e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0161  adenyltransferase  38.18 
 
 
136 aa  74.3  2e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.620989  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2488  hypothetical protein  25.25 
 
 
265 aa  64.7  2e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0454  hypothetical protein  26.07 
 
 
292 aa  57  3e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  24.65 
 
 
601 aa  55.1  1e-06  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0047  nucleotidyltransferase domain-containing protein  22.77 
 
 
259 aa  53.1  4e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  38.81 
 
 
113 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0824  nucleotidyltransferase  24.03 
 
 
265 aa  42.4  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.388218  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0068  hypothetical protein  24.12 
 
 
260 aa  42  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>