123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0030 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  100 
 
 
585 aa  1202  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  100 
 
 
585 aa  1202  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  100 
 
 
585 aa  1202  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0004  regulatory protein BlaR1  34.23 
 
 
585 aa  317  3e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0356117  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  34.4 
 
 
585 aa  315  1e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  33.5 
 
 
596 aa  315  2e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  34.63 
 
 
585 aa  310  4e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2825  Beta-lactamase  38.67 
 
 
405 aa  260  5e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.141892  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1887  beta-lactamase class D  31.88 
 
 
272 aa  125  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.131226  normal  0.0179427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0184  Beta-lactamase  30.99 
 
 
288 aa  124  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0412  penicillin-binding protein, transpeptidase  25.78 
 
 
283 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0605163 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1276  Beta-lactamase  28.95 
 
 
272 aa  123  9e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.261729  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3157  Beta-lactamase  30.36 
 
 
270 aa  123  1e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0838  Beta-lactamase  31.05 
 
 
295 aa  121  4e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  4.82216e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0813  Beta-lactamase  31.05 
 
 
295 aa  121  5e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00568131  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1050  Beta-lactamase  31.49 
 
 
262 aa  120  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2332  Beta-lactamase  32.44 
 
 
266 aa  120  8e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428372  normal  0.506587 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0837  beta-lactamase, putative  30.8 
 
 
265 aa  119  1e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3522  Beta-lactamase  30.59 
 
 
295 aa  119  2e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0845  Beta-lactamase  30.59 
 
 
295 aa  119  2e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.965986  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3328  Beta-lactamase  27.72 
 
 
265 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.306621  normal  0.885767 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1109  Beta-lactamase  29.36 
 
 
261 aa  117  7e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00564969  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0694  Beta-lactamase  27.72 
 
 
265 aa  117  8e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  5.96311e-06  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3353  Beta-lactamase  28.91 
 
 
277 aa  117  8e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3440  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.46 
 
 
265 aa  115  2e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  0.234091 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1596  Beta-lactamase  29.36 
 
 
263 aa  114  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.569759  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0483  putative beta-lactamase  32.67 
 
 
303 aa  114  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1435  Beta-lactamase  31.49 
 
 
262 aa  112  2e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0120  Beta-lactamase  29.46 
 
 
262 aa  110  7e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  25.94 
 
 
750 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3505  Beta-lactamase  28.97 
 
 
262 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3220  Beta-lactamase  28.12 
 
 
268 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0828246  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0301  Beta-lactamase  31.66 
 
 
264 aa  106  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  2.9774e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0907  Beta-lactamase  25.37 
 
 
267 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.175545  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2637  Beta-lactamase  31.53 
 
 
279 aa  104  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.578583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8961  Beta-lactamase  28.22 
 
 
302 aa  104  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  25.7 
 
 
728 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1441  Beta-lactamase  32.28 
 
 
279 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1405  hypothetical protein  32.51 
 
 
266 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1588  hypothetical protein  32.02 
 
 
266 aa  100  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0951  Beta-lactamase  28.37 
 
 
268 aa  100  9e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1053  beta-lactamase class D  30.05 
 
 
295 aa  98.2  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  27.19 
 
 
858 aa  97.8  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0344  beta-lactamase  30.38 
 
 
253 aa  97.4  6e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  24.77 
 
 
617 aa  97.1  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3016  Beta-lactamase  24.02 
 
 
264 aa  96.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.535281 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4544  Beta-lactamase  28.57 
 
 
266 aa  96.3  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.487352  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3930  Beta-lactamase  28.57 
 
 
275 aa  92.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.204659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72760  putative beta-lactamase  26.94 
 
 
262 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40823  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3817  Beta-lactamase  28.57 
 
 
275 aa  92.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485737 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2477  Beta-lactamase  27.19 
 
 
260 aa  92  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2220  beta-lactamase  26.86 
 
 
282 aa  91.7  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.526982  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0424  Beta-lactamase  28.04 
 
 
271 aa  91.7  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3962  Beta-lactamase  22.12 
 
 
271 aa  91.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6316  beta-lactamase PSE-2  25.42 
 
 
262 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4075  Beta-lactamase  22.12 
 
 
271 aa  91.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.709144 
 
 
-
 
NC_003296  RS02005  oxacillin hydrolase  27.91 
 
 
272 aa  90.9  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2849  Beta-lactamase  30.85 
 
 
269 aa  90.5  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3379  Beta-lactamase  30.48 
 
 
320 aa  90.5  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0077  hypothetical protein  30.61 
 
 
266 aa  89.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  hitchhiker  0.00231876  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3124  Beta-lactamase  22.17 
 
 
271 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3398  Beta-lactamase  26.47 
 
 
272 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.130069 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4788  Beta-lactamase  30.48 
 
 
270 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802032  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4137  Beta-lactamase  30.48 
 
 
270 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1106  class D beta-lactamase  28.86 
 
 
473 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56971  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2340  twin-arginine translocation pathway signal  22.31 
 
 
272 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0669803  normal  0.380486 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  27.37 
 
 
462 aa  89  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5028  Beta-lactamase (OXA-5), class D  23.58 
 
 
272 aa  88.2  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0373  beta-lactamase precursor  25.53 
 
 
269 aa  87.8  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2719  class D beta-lactamase  28.86 
 
 
269 aa  87.4  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.886076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2872  class D beta-lactamase  29.59 
 
 
269 aa  87  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314604  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0427  Beta-lactamase  22.78 
 
 
306 aa  85.9  2e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2040  Beta-lactamase  21.88 
 
 
300 aa  84.3  6e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  23.48 
 
 
417 aa  83.6  8e-15  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  23.3 
 
 
629 aa  83.6  1e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  24.92 
 
 
562 aa  83.2  1e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  23.3 
 
 
629 aa  83.6  1e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  21.86 
 
 
632 aa  82.4  2e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  21.53 
 
 
619 aa  81.6  3e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  26.64 
 
 
598 aa  81.6  3e-14  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0389  Beta-lactamase  24.77 
 
 
281 aa  81.3  4e-14  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.384736 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  21.3 
 
 
640 aa  81.3  5e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  22.56 
 
 
465 aa  79.3  2e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  20.88 
 
 
589 aa  78.6  3e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0211  Beta-lactamase  24.62 
 
 
274 aa  76.6  1e-12  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  23.08 
 
 
614 aa  76.3  2e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  25.17 
 
 
322 aa  75.1  3e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1383  conserved hypothetical protein, possible beta-lactamase  27.31 
 
 
248 aa  74.7  5e-12  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  23.6 
 
 
397 aa  73.2  1e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  23.77 
 
 
404 aa  72.8  2e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  25.87 
 
 
700 aa  71.2  5e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  26.1 
 
 
719 aa  71.2  5e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  34.09 
 
 
750 aa  70.5  8e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  25 
 
 
747 aa  69.7  1e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  25.1 
 
 
477 aa  68.9  2e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  25.6 
 
 
581 aa  68.6  3e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  23.25 
 
 
519 aa  67  8e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  24.31 
 
 
423 aa  66.6  1e-09  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  22.5 
 
 
541 aa  65.9  2e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  31.07 
 
 
403 aa  65.1  3e-09  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>