More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0027 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2523  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase UgpQ, putative  100 
 
 
247 aa  509  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0212323  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0027  glycerophosphodiester phosphodiesterase  100 
 
 
247 aa  509  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0027  glycerophosphodiester phosphodiesterase  100 
 
 
247 aa  509  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0337  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.02 
 
 
245 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0220885  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2092  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.18 
 
 
250 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.275875  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0608  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.84 
 
 
257 aa  147  2e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46198e-06 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4762  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.02 
 
 
247 aa  147  2e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0267  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.02 
 
 
247 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0866161  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03251  hypothetical protein  35.02 
 
 
247 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.957517  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03298  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.02 
 
 
247 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.96147  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5208  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.16 
 
 
249 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3875  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.44 
 
 
247 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0266  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.02 
 
 
247 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4041  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.58 
 
 
247 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3926  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.44 
 
 
247 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3646  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.15 
 
 
247 aa  142  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3727  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.18 
 
 
247 aa  141  1e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06395  lycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.05 
 
 
250 aa  139  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0129  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.76 
 
 
249 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3857  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.77 
 
 
248 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0220  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.65 
 
 
254 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0756  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.19 
 
 
244 aa  136  3e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.997295  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0653  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.19 
 
 
250 aa  135  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3651  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.23 
 
 
249 aa  134  1e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.652029 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2200  hypothetical protein  33.19 
 
 
239 aa  134  2e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0121  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.77 
 
 
249 aa  133  2e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2228  hypothetical protein  33.19 
 
 
239 aa  132  4e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0238  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.82 
 
 
249 aa  132  4e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3852  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.18 
 
 
249 aa  131  1e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.866919 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0260  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.23 
 
 
249 aa  130  2e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3958  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.23 
 
 
249 aa  130  2e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0262456  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3755  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.64 
 
 
246 aa  129  5e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3744  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.64 
 
 
246 aa  129  5e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3865  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.64 
 
 
246 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3924  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.64 
 
 
246 aa  128  7e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000853  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.24 
 
 
239 aa  128  7e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3822  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.64 
 
 
246 aa  128  1e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0513  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.35 
 
 
262 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.51 
 
 
235 aa  121  1e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.571737  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2095  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.69 
 
 
252 aa  120  1e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4506  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.95 
 
 
253 aa  120  2e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0660  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  30.42 
 
 
253 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4202  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.09 
 
 
261 aa  118  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1285  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  29.72 
 
 
248 aa  117  2e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000464019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5496  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.2 
 
 
241 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2677  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.71 
 
 
594 aa  116  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18890  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.17 
 
 
266 aa  116  4e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.231649  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5454  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  32.49 
 
 
241 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2051  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.33 
 
 
245 aa  114  1e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1875  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.34 
 
 
254 aa  114  1e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2333  glycerophosphodiester phosphodiesterase, cytosolic  29.39 
 
 
241 aa  114  2e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.11179e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3017  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.29 
 
 
253 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5070  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  32.2 
 
 
241 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.422276  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3786  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.86 
 
 
291 aa  112  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1160  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.39 
 
 
237 aa  112  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06765  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.41 
 
 
236 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1405  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.34 
 
 
243 aa  112  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  9.95679e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0576  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.96 
 
 
320 aa  112  8e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1506  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.06 
 
 
278 aa  111  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0302  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.75 
 
 
258 aa  111  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.640892  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3693  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.96 
 
 
253 aa  111  1e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0318  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.33 
 
 
254 aa  110  2e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204658  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2740  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.96 
 
 
253 aa  110  2e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2790  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.96 
 
 
253 aa  110  2e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1764  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.96 
 
 
253 aa  110  2e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3305  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.83 
 
 
247 aa  110  2e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.233023  normal  0.109896 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3721  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.96 
 
 
253 aa  110  2e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.694044  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3751  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.96 
 
 
253 aa  110  2e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0327  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.75 
 
 
254 aa  110  2e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.749062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2739  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.08 
 
 
249 aa  110  2e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.209911 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3213  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.96 
 
 
253 aa  110  2e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5466  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.78 
 
 
241 aa  110  2e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.78 
 
 
241 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1393  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.33 
 
 
242 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5222  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.78 
 
 
241 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5503  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.65 
 
 
241 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1776  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.61 
 
 
247 aa  108  7e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000170657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1811  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.61 
 
 
247 aa  108  7e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00873752  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2061  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.43 
 
 
604 aa  108  7e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.36158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5054  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  31.65 
 
 
241 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0399  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.5 
 
 
256 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5167  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.22 
 
 
241 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4126  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.2 
 
 
238 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2708  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.5 
 
 
256 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116697  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0378  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.5 
 
 
256 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0606  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.45 
 
 
239 aa  105  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.22 
 
 
241 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.86 
 
 
241 aa  105  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1189  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.54 
 
 
250 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0853  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.8 
 
 
247 aa  105  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.935369 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1111  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.28 
 
 
273 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2972  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.57 
 
 
303 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.74647 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13160  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.33 
 
 
249 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5469  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.25 
 
 
254 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2472  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.25 
 
 
291 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054422  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2048  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.03 
 
 
255 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3496  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.5 
 
 
256 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.09 
 
 
247 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1652  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.8 
 
 
247 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0258  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.43 
 
 
242 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>