289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0024 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 
159 aa  326  7e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  2.87275e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 
159 aa  326  7e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  91.19 
 
 
159 aa  305  2e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  2.24859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  62.26 
 
 
159 aa  206  8e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.53536e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  61.64 
 
 
159 aa  198  2e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  61.01 
 
 
159 aa  199  2e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  61.64 
 
 
159 aa  198  2e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  61.64 
 
 
159 aa  198  2e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  61.64 
 
 
159 aa  198  2e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  61.64 
 
 
159 aa  198  2e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  61.64 
 
 
159 aa  198  2e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  61.01 
 
 
159 aa  197  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  61.01 
 
 
159 aa  196  8e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  61.01 
 
 
167 aa  196  2e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  61.01 
 
 
167 aa  196  2e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  58.49 
 
 
159 aa  193  7e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  57.86 
 
 
159 aa  192  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  57.23 
 
 
159 aa  192  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  61.78 
 
 
177 aa  191  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  58.49 
 
 
159 aa  190  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  7.42092e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  55.97 
 
 
159 aa  189  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  55.97 
 
 
159 aa  189  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  57.23 
 
 
159 aa  184  5e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  54.72 
 
 
159 aa  182  2e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  53.46 
 
 
159 aa  181  5e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  54.37 
 
 
160 aa  180  7e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  55.97 
 
 
159 aa  175  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.7339e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 
159 aa  175  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  8.81248e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  54.09 
 
 
159 aa  175  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  50.94 
 
 
159 aa  174  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 
159 aa  171  3e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  52.2 
 
 
159 aa  168  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  7.43067e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  49.69 
 
 
159 aa  166  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  50.31 
 
 
159 aa  165  3e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 
159 aa  163  1e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  49.69 
 
 
160 aa  160  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  43.4 
 
 
160 aa  156  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.73176e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  46.54 
 
 
160 aa  156  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  42.77 
 
 
159 aa  155  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  49.69 
 
 
156 aa  154  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.14035e-07 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  47.8 
 
 
165 aa  152  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  46.54 
 
 
160 aa  147  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  44.94 
 
 
159 aa  146  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  45.28 
 
 
159 aa  143  9e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  44.03 
 
 
159 aa  142  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  42.77 
 
 
159 aa  141  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2340  rRNA large subunit methyltransferase  51.01 
 
 
155 aa  138  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.21376e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  42.77 
 
 
145 aa  135  3e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  44.65 
 
 
158 aa  133  8e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  37.11 
 
 
159 aa  132  2e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  43.83 
 
 
150 aa  132  2e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  7.74135e-12 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  39.62 
 
 
153 aa  130  8e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  41.77 
 
 
156 aa  130  8e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.09351e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  42.41 
 
 
157 aa  128  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  41.77 
 
 
157 aa  127  5e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  38.99 
 
 
153 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  38.36 
 
 
153 aa  124  4e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  43.04 
 
 
157 aa  124  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  39.13 
 
 
166 aa  123  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  38.99 
 
 
153 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  38.61 
 
 
157 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  39.38 
 
 
154 aa  120  9e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  40 
 
 
155 aa  120  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  1.20768e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  39.75 
 
 
162 aa  115  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  42.77 
 
 
154 aa  115  4e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  37.27 
 
 
162 aa  114  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1447  protein of unknown function DUF163  38.85 
 
 
154 aa  114  7e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000183222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  35.44 
 
 
157 aa  113  1e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 
157 aa  111  5e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  37.34 
 
 
152 aa  110  8e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.47821e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  33.96 
 
 
156 aa  109  1e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  35.9 
 
 
156 aa  109  1e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0548  hypothetical protein  34.78 
 
 
155 aa  109  1e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  37.18 
 
 
155 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 
155 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
155 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  37.82 
 
 
157 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 
155 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  31.45 
 
 
155 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl478  hypothetical protein  34.16 
 
 
155 aa  105  3e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  35.85 
 
 
154 aa  104  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 
155 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  32.7 
 
 
155 aa  104  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  38.99 
 
 
152 aa  104  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4366  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
155 aa  104  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712545  normal  0.959916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  34.18 
 
 
153 aa  103  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.67091e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  36.65 
 
 
154 aa  103  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 
155 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 
155 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 
155 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  32.08 
 
 
155 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  32.5 
 
 
157 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  32.5 
 
 
157 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  33.75 
 
 
160 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
155 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 
160 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  35.22 
 
 
154 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.55884e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 
155 aa  100  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  30.63 
 
 
156 aa  100  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  34.39 
 
 
155 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>