More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0005 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  71.68 
 
 
640 aa  884  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  55.14 
 
 
651 aa  688  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  62.68 
 
 
649 aa  774  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  57.17 
 
 
652 aa  700  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1416  DNA topoisomerase IV subunit B  52.34 
 
 
665 aa  645  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0092743  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 
640 aa  1320  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  53.15 
 
 
636 aa  679  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  3.63706e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  60.29 
 
 
794 aa  660  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  54.97 
 
 
657 aa  697  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  54.72 
 
 
642 aa  683  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  53.69 
 
 
645 aa  688  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0004  DNA gyrase, B subunit  59.89 
 
 
796 aa  654  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.783567 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  54.25 
 
 
654 aa  674  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.27299e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  70.35 
 
 
640 aa  874  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0006  DNA gyrase, B subunit  55.18 
 
 
686 aa  637  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629788 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1617  DNA topoisomerase IV subunit B  55.5 
 
 
656 aa  674  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.00667e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00050  DNA gyrase subunit B  54.69 
 
 
720 aa  676  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1443  DNA topoisomerase IV subunit B  52.34 
 
 
663 aa  646  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0710964  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 
640 aa  1320  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  54.7 
 
 
627 aa  665  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  52.5 
 
 
714 aa  672  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  52.7 
 
 
646 aa  681  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0005  DNA gyrase, B subunit  52.36 
 
 
647 aa  637  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  57.14 
 
 
661 aa  703  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  54.36 
 
 
655 aa  698  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  53.89 
 
 
655 aa  678  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  57.94 
 
 
637 aa  722  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  56.47 
 
 
654 aa  707  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1311  DNA gyrase subunit B  56.38 
 
 
641 aa  660  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1453  DNA gyrase, B subunit  54 
 
 
658 aa  667  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0006  DNA gyrase subunit B  53.16 
 
 
675 aa  674  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.313096 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  53.61 
 
 
675 aa  676  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  57.77 
 
 
648 aa  715  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  53.75 
 
 
655 aa  684  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  54.52 
 
 
655 aa  683  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  55.59 
 
 
719 aa  677  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  54.1 
 
 
659 aa  703  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  53.31 
 
 
675 aa  674  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  65.99 
 
 
638 aa  794  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  53.74 
 
 
655 aa  682  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  53.61 
 
 
675 aa  676  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  51.29 
 
 
656 aa  644  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  61.36 
 
 
641 aa  758  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  54.01 
 
 
651 aa  665  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  54.43 
 
 
643 aa  683  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  53.3 
 
 
647 aa  681  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  58.37 
 
 
635 aa  716  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  70.57 
 
 
640 aa  876  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  55.35 
 
 
654 aa  681  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  53.47 
 
 
636 aa  684  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  56.38 
 
 
641 aa  660  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  53.79 
 
 
634 aa  663  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  58.48 
 
 
635 aa  717  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  55.03 
 
 
654 aa  678  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  9.67673e-06  decreased coverage  6.94445e-13 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  65.3 
 
 
633 aa  803  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  6.95632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  55.5 
 
 
654 aa  684  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.39989e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  70.19 
 
 
640 aa  872  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  55.22 
 
 
644 aa  701  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  55.12 
 
 
651 aa  711  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  59.67 
 
 
802 aa  645  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  54.98 
 
 
643 aa  693  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  55.12 
 
 
644 aa  711  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  1.55334e-06 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  61.46 
 
 
640 aa  787  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  54.19 
 
 
649 aa  686  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  59.53 
 
 
796 aa  651  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  54.89 
 
 
650 aa  706  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  54.87 
 
 
654 aa  677  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  69.94 
 
 
640 aa  865  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  70.41 
 
 
640 aa  869  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  55.18 
 
 
695 aa  669  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.1906e-14 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  60.56 
 
 
642 aa  761  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  64.77 
 
 
642 aa  800  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  53.2 
 
 
653 aa  685  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  56.57 
 
 
637 aa  729  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  56.03 
 
 
645 aa  663  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  52.83 
 
 
650 aa  637  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  58.74 
 
 
645 aa  707  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  60.6 
 
 
650 aa  776  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.73734e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  57.57 
 
 
645 aa  686  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  49.18 
 
 
665 aa  642  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  70.19 
 
 
640 aa  872  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  55.5 
 
 
654 aa  684  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0296  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.69 
 
 
642 aa  643  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  60.71 
 
 
642 aa  723  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  54.55 
 
 
658 aa  685  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  56.06 
 
 
648 aa  677  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  6.47413e-07 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  64.47 
 
 
644 aa  809  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2676  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.18 
 
 
638 aa  639  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.29732e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  55.68 
 
 
636 aa  711  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0006  DNA gyrase subunit B  55.32 
 
 
685 aa  641  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  58.02 
 
 
802 aa  635  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  70.19 
 
 
640 aa  872  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  60.6 
 
 
633 aa  746  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  53.91 
 
 
655 aa  684  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2996  DNA gyrase, B subunit  54.75 
 
 
666 aa  674  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39538  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  57.7 
 
 
661 aa  697  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  56.47 
 
 
644 aa  701  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0010  DNA gyrase, B subunit  52.71 
 
 
680 aa  640  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  57.46 
 
 
643 aa  703  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  55.5 
 
 
654 aa  684  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>